RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-210	ENST00000415055	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PTPRB	P23467	1997 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	LNP1	A1A4G5	178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF197	O14709	1029 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SUV39H1	O43463	412 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	EXTL3	O43909	919 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	RHOBTB1	O94844	696 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MPIG6B	O95866	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MYL4	P12829	197 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MYF5	P13349	255 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	HAL	P42357	657 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ARPP19	P56211	112 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CDK17	Q00537	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	DSC1	Q08554	894 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	STIL	Q15468	1287 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	NOTUM	Q6P988	496 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	VIT	Q6UXI7	678 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ELMOD1	Q8N336	334 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SMARCD2	Q92925	531 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TMEM143	Q96AN5	459 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	OR10A5	Q9H207	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	DCLK1	O15075	740 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ENDOD1	O94919	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PCDH8	O95206	1070 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PRB1	P04280	392 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CYP21A2	P08686	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	C6	P13671	934 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF28	P17035	718 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	GJA1	P17302	382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CD53	P19397	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	FCAR	P24071	287 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	JAK3	P52333	1124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	HK3	P52790	923 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ANTXR2	P58335	489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	GRIK3	Q13003	919 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ADAM9	Q13443	819 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	FGL2	Q14314	439 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PLK5	Q496M5	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ALF	Q53S48	1182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	XKR3	Q5GH77	459 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	GPR65	Q8IYL9	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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