RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 MESP1Q9BRJ9 268 aa4.91□□□□□ -1.62
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PTPRK-209ENST00000415046 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.91□□□□□ -1.62
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PTPRK-209ENST00000415046 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
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PTPRK-209ENST00000415046 ABLIM3O94929 683 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
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PTPRK-209ENST00000415046 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 POLR2MP0CAP2 368 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRK-209ENST00000415046 ARHGAP25P42331 645 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRK-209ENST00000415046 GTF3C6Q969F1 213 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRK-209ENST00000415046 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
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PTPRK-209ENST00000415046 ELOVL5Q9NYP7 299 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 GABBR1Q9UBS5 961 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 IP6K2Q9UHH9 426 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 KCNJ14Q9UNX9 436 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 PTPRSQ13332 1948 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 TRIP11Q15643 1979 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 E5RJQ4 531 aa4.88□□□□□ -1.63
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