RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 FAM161BQ96MY7 647 aa20.55■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 SERPINB12Q96P63 405 aa20.55■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 VAT1Q99536 393 aa20.55■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 MUC3BQ9H195 1237 aa20.55■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 PDFQ9HBH1 243 aa20.55■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.55■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 ILVBLA1L0T0 632 aa20.54■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 SOBPA7XYQ1 873 aa20.54■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 PRAMEF11O60813 436 aa20.54■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 GJB3O75712 270 aa20.54■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 FDFT1P37268 417 aa20.54■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 CDH18Q13634 790 aa20.54■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 SLMAPQ14BN4 828 aa20.54■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 KYNUQ16719 465 aa20.54■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.54■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 FYB2Q5VWT5 728 aa20.54■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 ANKMY2Q8IV38 441 aa20.54■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 MFN1Q8IWA4 741 aa20.54■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 PGBD5Q8N414 524 aa20.54■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 EXOC4Q96A65 974 aa20.54■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 ZIM3Q96PE6 472 aa20.54■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.54■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.54■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 CBX4O00257 560 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 SNAP91O60641 907 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 USP12O75317 370 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 ACSL3O95573 720 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 CSKP41240 450 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 IL10RBQ08334 325 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 IQCKQ8N0W5 287 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 ASB16Q96NS5 453 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 NT5MQ9NPB1 228 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 AGPSO00116 658 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 MUSKO15146 869 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 MAGEA4P43358 317 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 LMAN1P49257 510 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 SLC29A2Q14542 456 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 BBS9Q3SYG4 887 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 MPPE1Q53F39 396 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 MARC1Q5VT66 337 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 TRIM68Q6AZZ1 485 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 LINGO4Q6UY18 593 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 IGDCC3Q8IVU1 814 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 FEM1AQ9BSK4 669 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 CLDND1Q9NY35 253 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 NINJ2Q9NZG7 142 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 PLAAQ9Y263 795 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.53■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.52■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 RIPK2O43353 540 aa20.52■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 SHBGP04278 402 aa20.52■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 TPSB2P20231 275 aa20.52■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 OXCT1P55809 520 aa20.52■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 ARL4CP56559 192 aa20.52■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 IHHQ14623 411 aa20.52■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 TPSAB1Q15661 275 aa20.52■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 CAPN12Q6ZSI9 719 aa20.52■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 APCDD1Q8J025 514 aa20.52■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 ALG14Q96F25 216 aa20.52■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 ASIC4Q96FT7 647 aa20.52■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 S1PR5Q9H228 398 aa20.52■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 GLOD4Q9HC38 313 aa20.52■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 KDELR3O43731 214 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 CD70P32970 193 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 LTBRP36941 435 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 MMP13P45452 471 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 RENBPP51606 427 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 ARF5P84085 180 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 LBRQ14739 615 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 ANO4Q32M45 955 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 CFAP58Q5T655 872 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 KCTD11Q693B1 232 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 CENPUQ71F23 418 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 APOL2Q9BQE5 337 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 NFS1Q9Y697 457 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 NDC80O14777 642 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 ATP8B1O43520 1251 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 CACNG3O60359 315 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 IGFBP4P22692 258 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 LMAN2Q12907 356 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.51■□□□□ 0.87
ODC1-202ENST00000405333 LY6G5CQ5SRR4 150 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms