RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 FERMT1Q9BQL6 677 aa28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 HPS4Q9NQG7 708 aa28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 C2CD4DB7Z1M9 353 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 MATN3O15232 486 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 NFATC1O95644 943 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADH1CP00326 375 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADH5P11766 374 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTPN3P26045 913 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD70P32970 193 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZBTB17Q13105 803 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 PDGFRLQ15198 375 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 LEKR1Q6ZMV7 388 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC45Q96CN5 670 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR51B4Q9Y5P0 310 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 C5orf60A6NFR6 353 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 TP73O15350 636 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ITGA8P53708 1063 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPS1Q13098 491 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 HTR4Q13639 388 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 P3H1Q32P28 736 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 APCDD1Q8J025 514 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 BBOF1Q8ND07 529 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 USP33Q8TEY7 942 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALG14Q96F25 216 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACBD3Q9H3P7 528 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ECT2Q9H8V3 914 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 VPS28Q9UK41 221 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANHXE9PGG2 379 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 MTSS1O43312 755 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 KDELR3O43731 214 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 GCATO75600 419 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 PEX11BO96011 259 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 JCHAINP01591 159 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCNB1P14635 433 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 HLA-FP30511 346 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 GDI1P31150 447 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 GAD2Q05329 585 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL10RBQ08334 325 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 IZUMO3Q5VZ72 239 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMC3Q7Z5M5 1100 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF567Q8N184 647 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 LMLNQ96KR4 655 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABCB8Q9NUT2 735 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANAPC5Q9UJX4 755 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A0A0MRY4 1105 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 CBX4O00257 560 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRAMEF11O60813 436 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 STK10O94804 968 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACTN2P35609 894 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ETFBP38117 255 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 OXCT1P55809 520 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 CAV1Q03135 178 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPATA13Q96N96 652 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 PDFQ9HBH1 243 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACTL7AQ9Y615 435 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 TEX44Q53QW1 395 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 TTC8Q8TAM2 541 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAML1Q92585 1016 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 GTSE1Q9NYZ3 720 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 OGFRQ9NZT2 677 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM24O15164 1050 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHADO15335 359 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNAP91O60641 907 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 LEXMQ3ZCV2 418 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 PID1Q7Z2X4 250 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 C12orf40Q86WS4 652 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZBTB9Q96C00 473 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 AGAP3Q96P47 875 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 PAK5Q9P286 719 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 CACNG3O60359 315 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPFIA2O75334 1257 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC10A7Q0GE19 358 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 RUNX3Q13761 415 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 FATE1Q969F0 183 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL12RB2Q99665 862 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 TXLNGYQ9BZA5 131 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARF5P84085 180 aa28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 GAB4Q2WGN9 574 aa28.25■■■□□ 2.11
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