RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379599.6

NHLRC3-201, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-201ENST00000379599 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.64□□□□□ -1.03
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NHLRC3-201ENST00000379599 PJA1Q8NG27 643 aa8.64□□□□□ -1.03
NHLRC3-201ENST00000379599 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.64□□□□□ -1.03
NHLRC3-201ENST00000379599 SDR42E1Q8WUS8 393 aa8.64□□□□□ -1.03
NHLRC3-201ENST00000379599 ST8SIA2Q92186 375 aa8.64□□□□□ -1.03
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NHLRC3-201ENST00000379599 LRRC37A3O60309 1634 aa8.64□□□□□ -1.03
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NHLRC3-201ENST00000379599 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.033e-9■■■■■ 31.5
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NHLRC3-201ENST00000379599 OR2T34Q8NGX1 318 aa8.63□□□□□ -1.03
NHLRC3-201ENST00000379599 AFG1LQ8WV93 481 aa8.63□□□□□ -1.03
NHLRC3-201ENST00000379599 ELMO1Q92556 727 aa8.63□□□□□ -1.03
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NHLRC3-201ENST00000379599 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.63□□□□□ -1.03
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NHLRC3-201ENST00000379599 USTQ9Y2C2 406 aa8.63□□□□□ -1.03
NHLRC3-201ENST00000379599 RIPK3Q9Y572 518 aa8.63□□□□□ -1.03
NHLRC3-201ENST00000379599 ISPDA4D126 451 aa8.63□□□□□ -1.03
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NHLRC3-201ENST00000379599 CD58P19256 250 aa8.63□□□□□ -1.03
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC1A6P48664 564 aa8.63□□□□□ -1.03
NHLRC3-201ENST00000379599 APLP1P51693 650 aa8.63□□□□□ -1.03
NHLRC3-201ENST00000379599 CASP7P55210 303 aa8.63□□□□□ -1.03
NHLRC3-201ENST00000379599 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NHLRC3-201ENST00000379599 GTF2IP78347 998 aa8.63□□□□□ -1.03
NHLRC3-201ENST00000379599 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.63□□□□□ -1.03
NHLRC3-201ENST00000379599 MSS51Q4VC12 460 aa8.63□□□□□ -1.03
NHLRC3-201ENST00000379599 Q5BKY6 102 aa8.63□□□□□ -1.03
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