RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 CAV1Q03135 178 aa18.13■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 LMAN2Q12907 356 aa18.13■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 GRM2Q14416 872 aa18.13■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 EMBQ6PCB8 327 aa18.13■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 LINGO4Q6UY18 593 aa18.13■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 APCDD1Q8J025 514 aa18.13■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 NAT16Q8N8M0 369 aa18.13■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 NAT8LQ8N9F0 302 aa18.13■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 NSMCE1Q8WV22 266 aa18.13■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 OSCP1Q8WVF1 389 aa18.13■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 PPM1EQ8WY54 764 aa18.13■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 MAML1Q92585 1016 aa18.13■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 TEKT5Q96M29 485 aa18.13■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 GORASP1Q9BQQ3 440 aa18.13■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 PDFQ9HBH1 243 aa18.13■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 TRHDEQ9UKU6 1024 aa18.13■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 SHOC2Q9UQ13 582 aa18.13■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 PENKP01210 267 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 TYRP14679 529 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 MAXP61244 160 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 COL19A1Q14993 1142 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 MPP7Q5T2T1 576 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 VITQ6UXI7 678 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 C4orf22Q6V702 233 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 PCGF5Q86SE9 256 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 SMRP1Q8NCR6 262 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 VAT1Q99536 393 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 FEM1AQ9BSK4 669 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 ZFP14Q9HCL3 533 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 ABCB8Q9NUT2 735 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 ZNF446Q9NWS9 450 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 UBP1Q9NZI7 540 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 CD207Q9UJ71 328 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 KDELR3O43731 214 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 BANF1O75531 89 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 FDFT1P37268 417 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 MMP13P45452 471 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 ITKQ08881 620 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 SEMA5AQ13591 1074 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 SPARCL1Q14515 664 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 LBRQ14739 615 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 DHCR24Q15392 516 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 PARP6Q2NL67 630 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 EML3Q32P44 896 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 TMCO4Q5TGY1 634 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 MARC1Q5VT66 337 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 CAVIN3Q969G5 261 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 OTUB2Q96DC9 234 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 EBF3Q9H4W6 596 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 TRPV4Q9HBA0 871 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 IGSF9Q9P2J2 1179 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 HPCAL4Q9UM19 191 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 OR51B4Q9Y5P0 310 aa18.12■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 CHADO15335 359 aa18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 LAMP2P13473 410 aa18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 TNK2Q07912 1038 aa18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 OLIG2Q13516 323 aa18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 PARM1Q6UWI2 310 aa18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 ZNF783Q6ZMS7 281 aa18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 TMC3Q7Z5M5 1100 aa18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 HOOK3Q86VS8 718 aa18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 SPATA22Q8NHS9 363 aa18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 FIBINQ8TAL6 211 aa18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 TTC8Q8TAM2 541 aa18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 EXOC4Q96A65 974 aa18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 FAM129AQ9BZQ8 928 aa18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 GLOD4Q9HC38 313 aa18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 VPS51Q9UID3 782 aa18.11■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 DENND4AQ7Z401 1863 aa18.1■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 TRIM24O15164 1050 aa18.1■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 GJB3O75712 270 aa18.1■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 ADH5P11766 374 aa18.1■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 KCNA5P22460 613 aa18.1■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 HLA-FP30511 346 aa18.1■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 RENBPP51606 427 aa18.1■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 ARF5P84085 180 aa18.1■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 ZNF235Q14590 738 aa18.1■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 RNF43Q68DV7 783 aa18.1■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 PGBD5Q8N414 524 aa18.1■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 ALG14Q96F25 216 aa18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms