RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317040.11

MVB12A-201, Transcript of multivesicular body subunit 12A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MVB12A, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12A-201ENST00000317040 OLFM1Q99784 485 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 DNAI2Q9GZS0 605 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 CXorf21Q9HAI6 301 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 H3BMQ9 156 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 PIK3R2O00459 728 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 AKAP10O43572 662 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 SULT1C4O75897 302 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF24P17028 368 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 CDH3P22223 829 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 MPSTP25325 297 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 CCR3P51677 355 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 EFNA5P52803 228 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 ANKDD1AQ495B1 522 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 TRNP1Q6NT89 227 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 HERC6Q8IVU3 1022 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 SLC15A3Q8IY34 581 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 FAM47BQ8NA70 645 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 CDCA5Q96FF9 252 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 COG8Q96MW5 612 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa19.51■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 HEATR9A2RTY3 570 aa19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 GIPC1O14908 333 aa19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 B4GALT4O60513 344 aa19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 VDRP11473 427 aa19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 COL6A2P12110 1019 aa19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 TFEBP19484 476 aa19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 EEPD1Q7L9B9 569 aa19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 TMEM143Q96AN5 459 aa19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 TCF12Q99081 682 aa19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 SLC29A1Q99808 456 aa19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 CD320Q9NPF0 282 aa19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 GID8Q9NWU2 228 aa19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 GIN1Q9NXP7 522 aa19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 SLC17A6Q9P2U8 582 aa19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 A0A096LPK6 155 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 TIMM44O43615 452 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 EDN1P05305 212 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 CYP2F1P24903 491 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 TNFSF9P41273 254 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 ACTR2P61160 394 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 CTBSQ01459 385 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 ZBTB17Q13105 803 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 CCDC14Q49A88 953 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 MTX3Q5HYI7 312 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF667Q5HYK9 610 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 TMEM53Q6P2H8 277 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 HACD2Q6Y1H2 254 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 TNS4Q8IZW8 715 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 GOLM1Q8NBJ4 401 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 SLCO4A1Q96BD0 722 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 CYP3A43Q9HB55 503 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF358Q9NW07 568 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 ADA2Q9NZK5 511 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 TRPC5OSA6NMA1 111 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 M0QYV0 167 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 ADAM23O75077 832 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 ATE1O95260 518 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 FUCA1P04066 466 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 HOXC6P09630 235 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 CD1EP15812 388 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 MGAT1P26572 445 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 GABRB3P28472 473 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 DPYSL2Q16555 572 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 CAMK1DQ8IU85 385 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 RNF148Q8N7C7 305 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 LPAR1Q92633 364 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 SEPT3Q9UH03 358 aa19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
MVB12A-201ENST00000317040 SNX13Q9Y5W8 968 aa19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms