RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309576.10

PPARG-202, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene PPARG, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-202ENST00000309576 TEX35Q5T0J7 233 aa20.3■□□□□ 0.84
PPARG-202ENST00000309576 TEX26Q8N6G2 289 aa20.3■□□□□ 0.84
PPARG-202ENST00000309576 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.3■□□□□ 0.84
PPARG-202ENST00000309576 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PPARG-202ENST00000309576 DEC1Q9P2X7 70 aa20.3■□□□□ 0.84
PPARG-202ENST00000309576 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.3■□□□□ 0.84
PPARG-202ENST00000309576 FAM187AA6NFU0 413 aa20.3■□□□□ 0.84
PPARG-202ENST00000309576 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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PPARG-202ENST00000309576 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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PPARG-202ENST00000309576 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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PPARG-202ENST00000309576 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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PPARG-202ENST00000309576 SPATA13Q96N96 652 aa20.29■□□□□ 0.84
PPARG-202ENST00000309576 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
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PPARG-202ENST00000309576 PRRT4C9JH25 899 aa20.28■□□□□ 0.84
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PPARG-202ENST00000309576 PPP1R7Q15435 360 aa20.28■□□□□ 0.84
PPARG-202ENST00000309576 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa20.28■□□□□ 0.84
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PPARG-202ENST00000309576 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa20.28■□□□□ 0.84
PPARG-202ENST00000309576 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa20.28■□□□□ 0.84
PPARG-202ENST00000309576 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.28■□□□□ 0.84
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PPARG-202ENST00000309576 VAT1Q99536 393 aa20.28■□□□□ 0.84
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PPARG-202ENST00000309576 ERP44Q9BS26 406 aa20.28■□□□□ 0.84
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PPARG-202ENST00000309576 MARC1Q5VT66 337 aa20.28■□□□□ 0.84
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PPARG-202ENST00000309576 SFTPA1Q8IWL2 248 aa20.28■□□□□ 0.84
PPARG-202ENST00000309576 USP33Q8TEY7 942 aa20.28■□□□□ 0.84
PPARG-202ENST00000309576 SEC14L1Q92503 715 aa20.28■□□□□ 0.84
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PPARG-202ENST00000309576 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.28■□□□□ 0.84
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PPARG-202ENST00000309576 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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PPARG-202ENST00000309576 CYTH1Q15438 398 aa20.27■□□□□ 0.84
PPARG-202ENST00000309576 TRADDQ15628 312 aa20.27■□□□□ 0.84
PPARG-202ENST00000309576 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PPARG-202ENST00000309576 TXNDC11Q6PKC3 985 aa20.27■□□□□ 0.84
PPARG-202ENST00000309576 PGBD5Q8N414 524 aa20.27■□□□□ 0.84
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PPARG-202ENST00000309576 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa20.27■□□□□ 0.84
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PPARG-202ENST00000309576 OPHN1O60890 802 aa20.26■□□□□ 0.83
PPARG-202ENST00000309576 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PPARG-202ENST00000309576 METTL18O95568 372 aa20.26■□□□□ 0.83
PPARG-202ENST00000309576 HLA-DQB2P05538 268 aa20.26■□□□□ 0.83
PPARG-202ENST00000309576 SRFP11831 508 aa20.26■□□□□ 0.83
PPARG-202ENST00000309576 BMP1P13497 986 aa20.26■□□□□ 0.83
PPARG-202ENST00000309576 CTHP32929 405 aa20.26■□□□□ 0.83
PPARG-202ENST00000309576 VPS41P49754 854 aa20.26■□□□□ 0.83
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