RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 CACNA1GO43497 2377 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 A0A0D9SEW6 157 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 DRGXA6NNA5 263 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 C1SP09871 688 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 CDK4P11802 303 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 RRM1P23921 792 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 CHRNA3P32297 505 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 SCNN1AP37088 669 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 ACADVLP49748 655 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 CLDN6P56747 220 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 SLC25A52Q3SY17 297 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 TAF3Q5VWG9 929 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 PDZD3Q86UT5 571 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 XYLT1Q86Y38 959 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 C1orf74Q96LT6 269 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.09■□□□□ 0.81
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CXCL3-201ENST00000296026 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
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CXCL3-201ENST00000296026 JUPP14923 745 aa20.08■□□□□ 0.81
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CXCL3-201ENST00000296026 FLT3P36888 993 aa20.08■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 C2CD6Q53TS8 623 aa20.08■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.08■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 LINGO4Q6UY18 593 aa20.08■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 TMIEQ8NEW7 156 aa20.08■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 TSC1Q92574 1164 aa20.08■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 ARRDC3Q96B67 414 aa20.08■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 KLHDC7BQ96G42 594 aa20.08■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 MYOCQ99972 504 aa20.08■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1W2PQU0 124 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 GOLGA8SH3BPF8 625 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 SLC31A1O15431 190 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 SRGAP2O75044 1071 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 SDC3O75056 442 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 OR1E1P30953 314 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 CLCN6P51797 869 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC15Q0P6D6 951 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 C6orf118Q5T5N4 469 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 CHST14Q8NCH0 376 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 KLK6Q92876 244 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 SCUBE2Q9NQ36 999 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 DYRK4Q9NR20 520 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM51Q9NW97 253 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 RNF103O00237 685 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 PRNPP04156 253 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 UCHL3P15374 230 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 PRLRP16471 622 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 GLDCP23378 1020 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 TRNP1Q6NT89 227 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 NEK5Q6P3R8 708 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM145Q8NBT3 493 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 OR7D4Q8NG98 312 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 CFAP57Q96MR6 1250 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 DACH1Q9UI36 760 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 LSM8O95777 96 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 MMEP08473 750 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 THEGLP0DJG4 465 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 CKMT2P17540 419 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF284Q2VY69 593 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ARSIQ5FYB1 569 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ARTNQ5T4W7 220 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 HES3Q5TGS1 186 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 FBXL19Q6PCT2 694 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 HORMAD1Q86X24 394 aa20.05■□□□□ 0.8
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CXCL3-201ENST00000296026 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 CPA5Q8WXQ8 436 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 NXPE2Q96DL1 559 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 HAPLN3Q96S86 360 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 SPON2Q9BUD6 331 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 IL36AQ9UHA7 158 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ITPR1Q14643 2758 aa20.05■□□□□ 0.8
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