RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289228.6

ACTR1B-201, Transcript of ARP1 actin related protein 1 homolog B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTR1B, Length 2,243 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1B-201ENST00000289228 TSNARE1Q96NA8 513 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 SMOQ99835 787 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CCDC28BQ9BUN5 200 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CNGB3Q9NQW8 809 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 NEMP1O14524 444 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 FAM163BP0C2L3 166 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 UQCRBP14927 111 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 SAT1P21673 171 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PIK3R1P27986 724 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CDH17Q12864 832 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PRPSAP1Q14558 356 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 TRIP10Q15642 601 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 LIPMQ5VYY2 423 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 KBTBD6Q86V97 674 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 GALNT15Q8N3T1 639 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 TEKT5Q96M29 485 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 GPR22Q99680 433 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 APBA2Q99767 749 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 COLEC11Q9BWP8 271 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 DRC3Q9H069 523 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 ACSS2Q9NR19 701 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 TK2O00142 265 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PTGESO14684 152 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 HDAC3O15379 428 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 JCHAINP01591 159 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.272e-7■□□□□ 11.2
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ACTR1B-201ENST00000289228 RPL14P50914 215 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 AQP4P55087 323 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 MED21Q13503 144 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 ITGA7Q13683 1181 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 MFSD10Q14728 455 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PPP2R5DQ14738 602 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 SEL1L3Q68CR1 1132 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 FAM35AQ86V20 835 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 SCYL1Q96KG9 808 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PPP1R36Q96LQ0 422 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 EPAS1Q99814 870 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 WDCPQ9H6R7 721 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 RNF181Q9P0P0 153 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CCDC78A2IDD5 438 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 H3BNX3 289 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 AIM2O14862 343 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CALRP27797 417 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CSRP3P50461 194 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 NUDT2P50583 147 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 GRB14Q14449 540 aa23■■□□□ 1.27
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ACTR1B-201ENST00000289228 LDLRAD1Q5T700 205 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 OR12D3Q9UGF7 316 aa23■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 AP3B1O00203 1094 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 TREHO43280 583 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CCR10P46092 362 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 POLE2P56282 527 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 SNX32Q86XE0 403 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 TMEM151AQ8N4L1 468 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CNDP1Q96KN2 507 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 SENP8Q96LD8 212 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 ZFP42Q96MM3 310 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 SH3GL3Q99963 347 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 TKTL2Q9H0I9 626 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 RHOJQ9H4E5 214 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 RGSL1A5PLK6 1076 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CABYRO75952 493 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PIGNO95427 931 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 F9P00740 461 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 SBK3P0C264 359 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CD1EP15812 388 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 EPHA3P29320 983 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 HK2P52789 917 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PRKAA2P54646 552 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 RAB41Q5JT25 222 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 C16orf89Q6UX73 402 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 EDEM1Q92611 657 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 SCN4AP35499 1836 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 BTBD19C9JJ37 291 aa22.98■■□□□ 1.27
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