RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 FCRL5Q96RD9 977 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 DHRS4Q9BTZ2 278 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PDFQ9HBH1 243 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ASAH2Q9NR71 780 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TTLL3Q9Y4R7 772 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CREB1P16220 341 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MGAT1P26572 445 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MMP13P45452 471 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 IFNAR2P48551 515 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ERVK-21P61565 698 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SKOR1P84550 965 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 RABGAP1LQ5R372 815 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TDRPQ86YL5 185 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ELMOD1Q8N336 334 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TEX26Q8N6G2 289 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC77Q9BR77 488 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CERS4Q9HA82 394 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CASS4Q9NQ75 786 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CKMP06732 381 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 IVLP07476 585 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CDC25CP30307 473 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PHBP35232 272 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 GNA12Q03113 381 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC5A9Q2M3M2 681 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 POTEHQ6S545 545 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 LEKR1Q6ZMV7 388 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM217AQ8IXS0 508 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PGBD5Q8N414 524 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 OR7D4Q8NG98 312 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 APOL2Q9BQE5 337 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SYBUQ9NX95 663 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ACTL7AQ9Y615 435 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SDR42E2A6NKP2 422 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PRAMEF11O60813 436 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CLDN11O75508 207 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 LATS1O95835 1130 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CPP00450 1065 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TNK2Q07912 1038 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 IL10RBQ08334 325 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ANO4Q32M45 955 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 RIN3Q8TB24 985 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SMYD2Q9NRG4 433 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 FETUBQ9UGM5 382 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1B0GVM2 712 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TCAF2A6NFQ2 919 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 C1RP00736 705 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 GLDCP23378 1020 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 RENBPP51606 427 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MAXP61244 160 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 GPM6BQ13491 265 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 FSCBQ5H9T9 825 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CHST9Q7L1S5 443 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 RTL10Q7L3V2 364 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGEH1Q9H213 219 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SP110Q9HB58 689 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CCL26Q9Y258 94 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MUSKO15146 869 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SPAG6O75602 509 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 GJB3O75712 270 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 RHOP08100 348 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MMP2P08253 660 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PRKCHP24723 683 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 HOXA9P31269 272 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ADRA1AP35348 466 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP2R2AP63151 447 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 NIPAL4Q0D2K0 466 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 RASA2Q15283 850 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MARC1Q5VT66 337 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 STEAP4Q687X5 459 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 DENND5AQ6IQ26 1287 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 HTR3DQ70Z44 454 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 UNC5BQ8IZJ1 945 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms