RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269844.4

PRDM15-201, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM15, Length 4,881 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-201ENST00000269844 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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PRDM15-201ENST00000269844 IFT43Q96FT9 208 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 TPK1Q9H3S4 243 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.63□□□□□ -0.07
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PRDM15-201ENST00000269844 RXRGP48443 463 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa14.63□□□□□ -0.07
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PRDM15-201ENST00000269844 MYDGFQ969H8 173 aa14.63□□□□□ -0.07
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PRDM15-201ENST00000269844 SLC35C1Q96A29 364 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.62□□□□□ -0.07
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PRDM15-201ENST00000269844 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 CCDC154A6NI56 674 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 C5orf58C9J3I9 102 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 H3BMM5 538 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 MYL12BO14950 172 aa14.62□□□□□ -0.07
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PRDM15-201ENST00000269844 MCOLN2Q8IZK6 566 aa14.62□□□□□ -0.07
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PRDM15-201ENST00000269844 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.62□□□□□ -0.07
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PRDM15-201ENST00000269844 FSCN2O14926 492 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 MYL3P08590 195 aa14.61□□□□□ -0.07
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PRDM15-201ENST00000269844 FSTL1Q12841 308 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 CSHL1Q14406 222 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 MPP5Q8N3R9 675 aa14.61□□□□□ -0.07
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PRDM15-201ENST00000269844 TOP1MTQ969P6 601 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 PHF21BQ96EK2 531 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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PRDM15-201ENST00000269844 HGSNATQ68CP4 663 aa14.61□□□□□ -0.07
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PRDM15-201ENST00000269844 OR2T3Q8NH03 318 aa14.61□□□□□ -0.07
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PRDM15-201ENST00000269844 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 RMND5AQ9H871 391 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 HSPB11Q9Y547 144 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 RAD54BQ9Y620 910 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PRDM15-201ENST00000269844 SLC37A4O43826 429 aa14.61□□□□□ -0.07
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