RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 CYP2C18P33260 490 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 DSG1Q02413 1049 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 CDH17Q12864 832 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZBTB17Q13105 803 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 OLIG2Q13516 323 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 HERC3Q15034 1050 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM110CQ1W6H9 321 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 ANO4Q32M45 955 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 CERCAMQ5T4B2 595 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 ARMC3Q5W041 872 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 NAPRTQ6XQN6 538 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 BEND5Q7L4P6 421 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 NPWQ8N729 165 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 POU5F2Q8N7G0 328 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 PPP2R3CQ969Q6 453 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 AZIN2Q96A70 460 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 VPS39Q96JC1 886 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 CNDP1Q96KN2 507 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 AGAP3Q96P47 875 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 AGAP2Q99490 1192 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 DRC3Q9H069 523 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 VCX3BQ9H321 246 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 RHOJQ9H4E5 214 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 NMRAL1Q9HBL8 299 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 OXSMQ9NWU1 459 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 Q9Y3F1 56 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9.8□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCDC189A1A4V9 331 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 ARHGAP42A6NI28 874 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 TARM1B6A8C7 271 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLCO1B7G3V0H7 640 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZBTB14O43829 449 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 AHCYL1O43865 530 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 PEX1O43933 1283 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 USP12O75317 370 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 FESP07332 822 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 SBK3P0C264 359 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 THRAP10827 490 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCNCP24863 283 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 HTR7P34969 479 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 GMPRP36959 345 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 CACNA2D1P54289 1103 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 MTTPP55157 894 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 IRF9Q00978 393 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 CDC16Q13042 620 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 GRM3Q14832 879 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 RALGPS1Q5JS13 557 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 CFAP157Q5JU67 520 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCID2Q5JVF3 399 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 MORN1Q5T089 497 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 C9orf131Q5VYM1 1079 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 IZUMO2Q6UXV1 221 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 DHDDSQ86SQ9 333 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 PDSS2Q86YH6 399 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 CNTN4Q8IWV2 1026 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 FBXW8Q8N3Y1 598 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF781Q8N8C0 355 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 GSTCDQ8NEC7 633 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 MAPK15Q8TD08 544 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 STYXQ8WUJ0 223 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 MFSD3Q96ES6 412 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 KCNK16Q96T55 309 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF385DQ9H6B1 395 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 COG4Q9H9E3 785 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 DDIT4Q9NX09 232 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 CDH22Q9UJ99 828 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 VPS28Q9UK41 221 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa9.79□□□□□ -0.84
IGHV3-54-201ENST00000622166 PATJQ8NI35 1801 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.2 ms