RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622090.4

DDB2-215, Transcript of damage specific DNA binding protein 2, human

TSL 5

Gene DDB2, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB2-215	ENST00000622090	PREB	Q9HCU5	417 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	SDK2	Q58EX2	2172 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	NBAS	A2RRP1	2371 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	POM121B	A6NF01	834 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	NEMP2	A6NFY4	417 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	MUSK	O15146	869 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	GJB6	O95452	261 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	FYN	P06241	537 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	HGF	P14210	728 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	PDGFRA	P16234	1089 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	AFM	P43652	599 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	RGS7	P49802	495 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	FGL2	Q14314	439 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	XKR5	Q6UX68	686 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090		Q6ZVU0	165 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	LGI2	Q8N0V4	545 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	SLC39A13	Q96H72	371 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
DDB2-215	ENST00000622090	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	RAD51B	O15315	384 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	TCEA3	O75764	348 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	MOCS3	O95396	460 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	CSF2	P04141	144 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	C4orf17	Q53FE4	359 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	HORMAD1	Q86X24	394 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SCML4	Q8N228	414 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	IQUB	Q8NA54	791 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	ALG14	Q96F25	216 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	IFT43	Q96FT9	208 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090		A6NNZ2	444 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PDXK	O00764	312 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	MCF2L	O15068	1137 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SPINT1	O43278	529 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	AQP9	O43315	295 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	ATP9B	O43861	1147 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	BNIP3L	O60238	219 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PPFIA2	O75334	1257 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	GCAT	O75600	419 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	LTF	P02788	710 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	AKT2	P31751	481 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	UGT1A5	P35504	534 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	IRAK1	P51617	712 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SLC8A3	P57103	927 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	FOXK1	P85037	733 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	NR0B2	Q15466	257 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	C8orf34	Q49A92	452 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	ACCSL	Q4AC99	568 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PMF1	Q6P1K2	205 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	C14orf80	Q86SX3	495 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	JAML	Q86YT9	394 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	RBFA	Q8N0V3	343 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	CACNA1D	Q01668	2161 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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