RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-231ENST00000600201 LRRC72A6NJI9 287 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 VILLO15195 856 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 ATP9BO43861 1147 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 ADH1BP00325 375 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 RRM1P23921 792 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 CXCR3P49682 368 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 BNIP3Q12983 259 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 DNAJC3Q13217 504 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 C19orf48Q6RUI8 117 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 PROSER1Q86XN7 944 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 SH2D3CQ8N5H7 860 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 EMC1Q8N766 993 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 OR7D4Q8NG98 312 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 CPA5Q8WXQ8 436 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 CFAP57Q96MR6 1250 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 GANQ9H2C0 597 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 ZNF212Q9UDV6 495 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 VPS51Q9UID3 782 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 VPS28Q9UK41 221 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 LRRK1Q38SD2 2015 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 CACNA1GO43497 2377 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 ACACAQ13085 2346 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 TBC1D3EA0A087X179 549 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 TBC1D3LB9A6J9 549 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 PES1O00541 588 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 PCDHGA12O60330 932 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 RHOCP08134 193 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 TBC1D3HP0C7X1 549 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 CHRNB2P17787 502 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 CD38P28907 300 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 GABRB2P47870 512 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 C21orf59P57076 290 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 NOMO3P69849 1222 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 SLC12A1Q13621 1099 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 NAA35Q5VZE5 725 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 DHRS13Q6UX07 377 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 KDM7AQ6ZMT4 941 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 EPS8L1Q8TE68 723 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 NT5C3BQ969T7 300 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 SERAC1Q96JX3 654 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 FAM81BQ96LP2 452 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 SPAG5Q96R06 1193 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 MUC3BQ9H195 1237 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 TNKS2Q9H2K2 1166 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 FZD3Q9NPG1 666 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 SLC25A13Q9UJS0 675 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 PPM1HQ9ULR3 514 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 F8VZ95 297 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 LATO43561 262 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 SDC3O75056 442 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 ENDOD1O94919 500 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 SLC2A3P11169 496 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 UCHL3P15374 230 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 PRLRP16471 622 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 CCR5P51681 352 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 CDH4P55283 916 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 NXPH1P58417 271 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 DEUP1Q05D60 604 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 BNIPLQ7Z465 357 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 FAM131BQ86XD5 332 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 JOSD2Q8TAC2 188 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 SAP25Q8TEE9 199 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 OR8D1Q8WZ84 308 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 NOX5Q96PH1 765 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 VPS16Q9H269 839 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 NDFIP2Q9NV92 336 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 TMEM59LQ9UK28 342 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 E9PAM4 449 aa15.21■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 CLDN11O75508 207 aa15.21■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 GFPT2O94808 682 aa15.21■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
FCHO1-231ENST00000600201 GRK6P43250 576 aa15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms