RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		9.37	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	CBX4	O00257	560 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	ETS1	P14921	441 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC7A5	Q01650	507 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	LMNB2	Q03252	620 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	JAML	Q86YT9	394 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	CPA6	Q8N4T0	437 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLCO2A1	Q92959	643 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	LMLN	Q96KR4	655 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM50B	Q9Y247	325 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	MUC3A	Q02505	3323 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNAP91	O60641	907 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	TULP3	O75386	442 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	GAS8	O95995	478 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCNC	P24863	283 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	ETFB	P38117	255 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	MESP2	Q0VG99	397 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP1R7	Q15435	360 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	SP110	Q9HB58	689 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		9.36	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF103	O00237	685 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	GJA4	P35212	333 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	VPS41	P49754	854 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLCN6	P51797	869 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	OXCT1	P55809	520 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF33A	Q06730	810 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	WASHC5	Q12768	1159 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	NR1H3	Q13133	447 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC89	Q8N998	374 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	EPC1	Q9H2F5	836 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	GGA2	Q9UJY4	613 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXO10	Q9UK96	956 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	CFAP69	A5D8W1	941 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRAMEF11	O60813	436 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	PEX11B	O96011	259 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	JCHAIN	P01591	159 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCNB1	P14635	433 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC6A11	P48066	632 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZBTB17	Q13105	803 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBXN4	Q92575	508 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	NXPE3	Q969Y0	559 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHFR	Q96EP1	664 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	VPS51	Q9UID3	782 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	MATN3	O15232	486 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	KDELR3	O43731	214 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZMPSTE24	O75844	475 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRT14	P02533	472 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	CISD3	P0C7P0	127 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTPN3	P26045	913 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	SOX9	P48436	509 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	DGKG	P49619	791 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL10RB	Q08334	325 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	GEN1	Q17RS7	908 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	FUT11	Q495W5	492 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINGO4	Q6UY18	593 aa		9.35	□□□□□ -0.91
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms