RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
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CTIF-208ENST00000590422 TSC1Q92574 1164 aa12.44□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 SKA1Q96BD8 255 aa12.44□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 LRIG1Q96JA1 1093 aa12.44□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 PSMB7Q99436 277 aa12.44□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 SCUBE2Q9NQ36 999 aa12.44□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 PIGVQ9NUD9 493 aa12.44□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa12.44□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 RWDD2AQ9UIY3 292 aa12.44□□□□□ -0.42
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CTIF-208ENST00000590422 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa12.44□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa12.44□□□□□ -0.42
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CTIF-208ENST00000590422 NNMTP40261 264 aa12.43□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 VASPP50552 380 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
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CTIF-208ENST00000590422 ARTNQ5T4W7 220 aa12.43□□□□□ -0.42
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CTIF-208ENST00000590422 TMPRSS12Q86WS5 348 aa12.43□□□□□ -0.42
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CTIF-208ENST00000590422 ZNF683Q8IZ20 524 aa12.43□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 SH2D3CQ8N5H7 860 aa12.43□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 MFSD2AQ8NA29 543 aa12.43□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa12.43□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 GPT2Q8TD30 523 aa12.43□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 MYOCQ99972 504 aa12.43□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa12.43□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 KIAA1468Q9P260 1216 aa12.43□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 SLC25A13Q9UJS0 675 aa12.43□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa12.43□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 A0A087WV48 116 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
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CTIF-208ENST00000590422 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 MCF2LO15068 1137 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 YKT6O15498 198 aa12.42□□□□□ -0.42
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CTIF-208ENST00000590422 MBD3O95983 291 aa12.42□□□□□ -0.42
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CTIF-208ENST00000590422 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 CAMK4Q16566 473 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 C5orf22Q49AR2 442 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 SLC45A4Q5BKX6 768 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 HES3Q5TGS1 186 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 FBXL19Q6PCT2 694 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 DSG4Q86SJ6 1040 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 NPY6RQ99463 290 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 SIK2Q9H0K1 926 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 MUC3BQ9H195 1237 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 KDM4CQ9H3R0 1056 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 VPS51Q9UID3 782 aa12.42□□□□□ -0.42
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CTIF-208ENST00000590422 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa12.41□□□□□ -0.42
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CTIF-208ENST00000590422 GLDCP23378 1020 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 RRM1P23921 792 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 NOS2P35228 1153 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 CXCR3P49682 368 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 CDH4P55283 916 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 PTK2Q05397 1052 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP12.41□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 FAM46CQ5VWP2 391 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 TRNP1Q6NT89 227 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 LINGO4Q6UY18 593 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 IQCHQ86VS3 1027 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 TMEM145Q8NBT3 493 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-208ENST00000590422 CHST14Q8NCH0 376 aa12.41□□□□□ -0.42
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