RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 FTSJ1Q9UET6 329 aa7.37□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.37□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 DACH1Q9UI36 760 aa7.37□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SARDHQ9UL12 918 aa7.37□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 FZD4Q9ULV1 537 aa7.37□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 STAP1Q9ULZ2 295 aa7.37□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCML1Q9UN30 329 aa7.37□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.37□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 F8VZ95 297 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 K7ERQ8 282 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 VILLO15195 856 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 EPHB6O15197 1021 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SRGAP2O75044 1071 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SDC3O75056 442 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLDN11O75508 207 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ENDOD1O94919 500 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 GJB6O95452 261 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 MT-CO1P00395 513 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 MMEP08473 750 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SRCP12931 536 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 UCHL3P15374 230 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRLRP16471 622 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 GLDCP23378 1020 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CD38P28907 300 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CXCR3P49682 368 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNX16P57768 344 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 BPIFB4P59827 614 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP11AP98196 1134 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC12A1Q13621 1099 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARID5BQ14865 1188 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRT31Q15323 416 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDO1Q16878 200 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 AGBL4Q5VU57 503 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 C19orf48Q6RUI8 117 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 DHRS13Q6UX07 377 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 DSG4Q86SJ6 1040 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM131BQ86XD5 332 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 DRC7Q8IY82 874 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SH2D3CQ8N5H7 860 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP11CQ8NB49 1132 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 C18orf8Q96DM3 657 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALG14Q96F25 216 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSMB7Q99436 277 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 NPY6RQ99463 290 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDC6Q99741 560 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 C11orf70Q9BRQ4 267 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPON2Q9BUD6 331 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 NLRC4Q9NPP4 1024 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 VPS51Q9UID3 782 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTPRBP23467 1997 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A0D9SEW6 157 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1B0GTQ1 180 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PR77 199 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 E9PAM4 449 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF103O00237 685 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 TAF4O00268 1085 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP9BO43861 1147 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ITGAVP06756 1048 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CTSLP07711 333 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 C7P10643 843 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 MSNP26038 577 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR1E1P30953 314 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNA2P51530 1060 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCR5P51681 352 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLK1P53350 603 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDH4P55283 916 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 OXCT1P55809 520 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 NOMO3P69849 1222 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRT83P78385 493 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNAJC3Q13217 504 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SHBQ15464 509 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 INAVAQ3KP66 663 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC25A52Q3SY17 297 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCP11X2Q5H9J9 407 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 BRMS1LQ5PSV4 323 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM46CQ5VWP2 391 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms