RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa24.55■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa24.55■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCDC66A2RUB6 948 aa24.54■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 WASH3PC4AMC7 463 aa24.54■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CBX4O00257 560 aa24.54■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZSCAN12O43309 604 aa24.54■■□□□ 1.52
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRKCHP24723 683 aa24.54■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STK19P49842 368 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 VASPP50552 380 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AFMIDQ63HM1 303 aa24.54■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HMCESQ96FZ2 354 aa24.54■■□□□ 1.52
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NNMTP40261 264 aa24.53■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CRY1Q16526 586 aa24.53■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF354CQ86Y25 554 aa24.53■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa24.53■■□□□ 1.52
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RNF157Q96PX1 679 aa24.53■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.53■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC39A8Q9C0K1 460 aa24.53■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HPCAL4Q9UM19 191 aa24.53■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa24.52■■□□□ 1.52
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KDELR3O43731 214 aa24.52■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EPHX1P07099 455 aa24.52■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HLA-EP13747 358 aa24.52■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 COL9A1P20849 921 aa24.52■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DGKEP52429 567 aa24.52■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ARF5P84085 180 aa24.52■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SERINC3Q13530 473 aa24.52■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa24.52■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RETSATQ6NUM9 610 aa24.52■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MFSD7Q6UXD7 560 aa24.52■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM92Q6UXU6 159 aa24.52■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PQLC3Q8N755 202 aa24.52■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EXD1Q8NHP7 514 aa24.52■■□□□ 1.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa24.52■■□□□ 1.52
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RAD54BQ9Y620 910 aa24.52■■□□□ 1.52
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KIAA1211LQ6NV74 962 aa24.5■■□□□ 1.51
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.5■■□□□ 1.51
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TSTD1Q8NFU3 115 aa24.5■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TRIM58Q8NG06 486 aa24.5■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.5■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa24.5■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CD248Q9HCU0 757 aa24.5■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MFSD11O43934 449 aa24.49■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MT-CO1P00395 513 aa24.49■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TDGF1P13385 188 aa24.49■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
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