RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 CDH4P55283 916 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 APBA1Q02410 837 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 CENPCQ03188 943 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 CNTN1Q12860 1018 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 BNIP3Q12983 259 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 CAMK4Q16566 473 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 LRRC31Q6UY01 552 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PDZD3Q86UT5 571 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 IQCHQ86VS3 1027 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PASD1Q8IV76 773 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 EID2Q8N6I1 236 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 MLKLQ8NB16 471 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ALG14Q96F25 216 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 CCDC114Q96M63 670 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SARDHQ9UL12 918 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 DMTF1Q9Y222 760 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 HS3ST4Q9Y661 456 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.38□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SPEGQ15772 3267 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PLK4O00444 970 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PAGE1O75459 146 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 RFPL3O75679 317 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ERBB2P04626 1255 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 CKMT2P17540 419 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 CLCN1P35523 988 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 CXCR3P49682 368 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 METAP1P53582 386 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PPP2CBP62714 309 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PPP2CAP67775 309 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 DNAJC3Q13217 504 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 NUMA1Q14980 2115 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SHBQ15464 509 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 POM121L1PQ3SYA9 428 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 C5orf22Q49AR2 442 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 BRMS1LQ5PSV4 323 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 NEK5Q6P3R8 708 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 Q6ZVU0 165 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SLC26A9Q7LBE3 791 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 C14orf80Q86SX3 495 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SLC47A2Q86VL8 602 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 TRIM69Q86WT6 500 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 IRF2BP1Q8IU81 584 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 TMEM35BQ8NCS4 154 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 TMIEQ8NEW7 156 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 FAM131CQ96AQ9 280 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 LRIG1Q96JA1 1093 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 C1orf74Q96LT6 269 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 TKTL2Q9H0I9 626 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PREBQ9HCU5 417 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 DYRK4Q9NR20 520 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 OR51B4Q9Y5P0 310 aa8.37□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 DRGXA6NNA5 263 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 CBX4O00257 560 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SLC31A1O15431 190 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 DAB1O75553 588 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 CNTN5O94779 1100 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ADCY5O95622 1261 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 MT-CO1P00395 513 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PRNPP04156 253 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 RHOCP08134 193 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SRCP12931 536 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 CHRNA3P32297 505 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 UBE2HP62256 183 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 E2F1Q01094 437 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 DEUP1Q05D60 604 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ILKQ13418 452 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ACAP1Q15027 740 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 HS1BP3Q53T59 392 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 AGBL4Q5VU57 503 aa8.36□□□□□ -1.07
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