RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552301.1

PRPF40B-216, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog B, human

TSL 5

Gene PRPF40B, Length 912 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRPF40B-216	ENST00000552301	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	NEU3	Q9UQ49	428 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	DMD	P11532	3685 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	THADA	Q6YHU6	1953 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	ATP9B	O43861	1147 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	OXTR	P30559	389 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	CLCN6	P51797	869 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	ZBTB16	Q05516	673 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	SPA17	Q15506	151 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	DLG2	Q15700	870 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	CA9	Q16790	459 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	ARTN	Q5T4W7	220 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	GANC	Q8TET4	914 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	HSPH1	Q92598	858 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	PANX2	Q96RD6	677 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301		H3BRJ5	948 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	BNIP3L	O60238	219 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	EPN2	O95208	641 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	SRC	P12931	536 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	CD6	P30203	668 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	ARL4A	P40617	200 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	TPMT	P51580	245 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	CREB5	Q02930	508 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	LINGO4	Q6UY18	593 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301		Q6ZVU0	165 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	STK40	Q8N2I9	435 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	DCLK2	Q8N568	766 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	FRMD1	Q8N878	549 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	INTU	Q9ULD6	942 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	SCML1	Q9UN30	329 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PRPF40B-216	ENST00000552301	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	WASH4P	A8MWX3	477 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	PROSC	O94903	275 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	GLDC	P23378	1020 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	CDC25B	P30305	580 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	GJC1	P36383	396 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	ACVRL1	P37023	503 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	PSMD8	P48556	350 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	SLC20A2	Q08357	652 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	KRT81	Q14533	505 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	RFX8	Q6ZV50	586 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	FAM124A	Q86V42	546 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	FRS2	Q8WU20	508 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	TEKT4	Q8WW24	435 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	RFFL	Q8WZ73	363 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	PTPRN2	Q92932	1015 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	CD93	Q9NPY3	652 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	RASA4B	C9J798	803 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	RASA4	O43374	803 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	LRP3	O75074	770 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	MT-CO1	P00395	513 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	RARA	P10276	462 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	VAV1	P15498	845 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	GOT1	P17174	413 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PRPF40B-216	ENST00000552301	IL1R2	P27930	398 aa		18.88	■□□□□ 0.61

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