RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	MMP21	Q8N119	569 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125		A0A0G2JK05	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	SLC16A2	P36021	539 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	MVD	P53602	400 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	DPP10	Q8N608	796 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	NCSTN	Q92542	709 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	STAM	Q92783	540 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	PEX12	O00623	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	KLK10	O43240	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	CBX6	O95503	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	BMP15	O95972	392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	MAPK9	P45984	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125		H3BNX3	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	HBP1	O60381	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TSPAN3	O60637	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	ATG13	O75143	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	EPN2	O95208	641 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	PSG1	P11464	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	CKMT1A	P12532	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	UBE3A	Q05086	875 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	ICK	Q9UPZ9	632 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TMCC1	O94876	653 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	PRKCH	P24723	683 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	CNTF	P26441	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	PTGR1	Q14914	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TWIST1	Q15672	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	GPSM1	Q86YR5	675 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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