RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516259.1

RNU6-390P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 390, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-390P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-390P-201ENST00000516259 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 FSD2A1L4K1 749 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TTC36A6NLP5 189 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 PRSS47A8MTI9 375 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SYN3O14994 580 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 PER2O15055 1255 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 MATN3O15232 486 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 PTP4A3O75365 173 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SERPINC1P01008 464 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 LYL1P12980 280 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 PROZP22891 400 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TYK2P29597 1187 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CPOXP36551 454 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 DRG2P55039 364 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 UFM1P61960 85 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CCNG2Q16589 344 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 C5orf22Q49AR2 442 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SH2D4BQ5SQS7 431 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TSTD2Q5T7W7 516 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 HAUS3Q68CZ6 603 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 IGFL4Q6B9Z1 124 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC30A9Q6PML9 568 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF627Q7L945 461 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 MON1AQ86VX9 555 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CHD1LQ86WJ1 897 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TICAM2Q86XR7 235 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 RHPN2Q8IUC4 686 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CPXM2Q8N436 756 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 METTL6Q8TCB7 284 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 RUFY2Q8WXA3 655 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 KCNJ9Q92806 393 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CUL5Q93034 780 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ASB2Q96Q27 587 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 FCRL5Q96RD9 977 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 MACROD1Q9BQ69 325 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 STRA6Q9BX79 667 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARL8BQ9NVJ2 186 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CLIC5Q9NZA1 410 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SERGEFQ9UGK8 458 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TLK1Q9UKI8 766 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 INSL6Q9Y581 213 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 A0A1W2PRG0 241 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 RRHO14718 337 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 MGST3O14880 152 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 STRNO43815 780 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 RNF8O76064 485 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 WNT1P04628 370 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CD63P08962 238 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TACR2P21452 398 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TM4SF1P30408 202 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 HOXD13P35453 343 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARL3P36405 182 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 PSMB10P40306 273 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CLK3P49761 638 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 INHBCP55103 352 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TUBA4AP68366 448 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 EFNB1P98172 346 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 NHLH1Q02575 133 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CYP4A11Q02928 519 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 DPTQ07507 201 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ACVR2BQ13705 512 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 IL13RA2Q14627 380 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 PROSER3Q2NL68 480 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC45A4Q5BKX6 768 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM268Q5VZI3 342 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM205BPQ63HN1 556 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ISM2Q6H9L7 571 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 NCAPH2Q6IBW4 605 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM81Q6P7N7 255 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 PCSK4Q6UW60 755 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 DEF8Q6ZN54 512 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 PRSS45Q7RTY3 260 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 PXKQ7Z7A4 578 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 MRGPRGQ86SM5 289 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 LDLRAD3Q86YD5 345 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SCAIQ8N9R8 606 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 HSPH1Q92598 858 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM149B1Q96BN6 582 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SEMA4CQ9C0C4 833 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms