RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495283.5

ALG13-223, Transcript of ALG13, UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit, human

TSL 2

Gene ALG13, Length 3,236 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ALG13-223	ENST00000495283	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	CRTAM	O95727	393 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	NAB1	Q13506	487 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	GK3P	Q14409	553 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	ZNF460	Q14592	562 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	GRM3	Q14832	879 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	KRT80	Q6KB66	452 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	FZD10	Q9ULW2	581 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	SEPT6	Q14141	434 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	PTK2B	Q14289	1009 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	PRPSAP1	Q14558	356 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	POU6F1	Q14863	301 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	PAOX	Q6QHF9	649 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	CYS1	Q717R9	158 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	CXorf38	Q8TB03	319 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	BTBD9	Q96Q07	612 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	SIK2	Q9H0K1	926 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	PCNT	O95613	3336 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	DDHD2	O94830	711 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	MAP3K7CL	P57077	242 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	CTBP1	Q13363	440 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	TMED1	Q13445	227 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	LSAMP	Q13449	338 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	DGKD	Q16760	1214 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	GEN1	Q17RS7	908 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	NADK2	Q4G0N4	442 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	SNX31	Q8N9S9	440 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	OSMR	Q99650	979 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	OCEL1	Q9H607	264 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	DDIT4	Q9NX09	232 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	TMEM233	B4DJY2	109 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283		H3BNX3	289 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283		H3BRB1	525 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	NFKBIE	O00221	500 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	DFFA	O00273	331 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	ZNF195	O14628	629 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	VAPB	O95292	243 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	TNFAIP8	O95379	198 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	SPATA31D3	P0C874	917 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	NCAM1	P13591	858 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	NFKB1	P19838	968 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	NMBR	P28336	390 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	RGS2	P41220	211 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	BAG6	P46379	1132 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	PRAME	P78395	509 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	PRKAA1	Q13131	559 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	STRADA	Q7RTN6	431 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	IPMK	Q8NFU5	416 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	PKP2	Q99959	881 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	CHST12	Q9NRB3	414 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	SETD4	Q9NVD3	440 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ALG13-223	ENST00000495283	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ALG13-223	ENST00000495283	TMEM114	B3SHH9	223 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ALG13-223	ENST00000495283		G3V2L1	256 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ALG13-223	ENST00000495283	DNAJA2	O60884	412 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ALG13-223	ENST00000495283	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ALG13-223	ENST00000495283	RECQL4	O94761	1208 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ALG13-223	ENST00000495283	PRKCG	P05129	697 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ALG13-223	ENST00000495283	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	10.77	□□□□□ -0.69	7e-7	■■□□□ 12.7
ALG13-223	ENST00000495283	PTPN3	P26045	913 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ALG13-223	ENST00000495283	PLK1	P53350	603 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ALG13-223	ENST00000495283	MS4A2	Q01362	244 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ALG13-223	ENST00000495283	ANO4	Q32M45	955 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ALG13-223	ENST00000495283	LIPM	Q5VYY2	423 aa		10.77	□□□□□ -0.69

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