RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491123.5

SUCLG1-208, Transcript of succinate-CoA ligase alpha subunit, human

TSL 3

Gene SUCLG1, Length 1,073 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUCLG1-208	ENST00000491123	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	TPP1	O14773	563 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZBED1	O96006	694 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	GABRB3	P28472	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	TLE3	Q04726	772 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	DLG1	Q12959	904 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	FBXO17	Q96EF6	278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	KRT5	P13647	590 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	EGR1	P18146	543 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	DGKA	P23743	735 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM193A	P78312	1265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123		J3KTA2	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	CLGN	O14967	610 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	MYL4	P12829	197 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	CYP3A7	P24462	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	CSHL1	Q14406	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	PLK5	Q496M5	336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	MON1B	Q7L1V2	547 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	PHKB	Q93100	1093 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	SNX27	Q96L92	541 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	EDIL3	O43854	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	AMBP	P02760	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	CYP3A4	P08684	503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	FGFR2	P21802	821 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	MXI1	P50539	228 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	CDH12	P55289	794 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	ITM2A	O43736	263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	PHEX	P78562	749 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	GDF15	Q99988	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	HSPB6	O14558	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	NDST3	O95803	873 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	TUBA1A	Q71U36	451 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	PGBD5	Q8N414	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	P2RY10	O00398	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	CER1	O95813	267 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	CRYAA	P02489	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	IDE	P14735	1019 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	PEX5	P50542	639 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	EPHB1	P54762	984 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms