RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 HSPA12BQ96MM6 686 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAJC7Q99615 494 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 BTBD1Q9H0C5 482 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 THAP2Q9H0W7 228 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 HPCAL4Q9UM19 191 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 MEI4A8MW99 385 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 BNIP3LO60238 219 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 ITPKAP23677 461 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC8A1P32418 973 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 ID4P47928 161 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 ADKP55263 362 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC20A2Q08357 652 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 CST6Q15828 149 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 WDR45BQ5MNZ6 344 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 ARTNQ5T4W7 220 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 ERMARDQ5T6L9 678 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 DSG4Q86SJ6 1040 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 NLRP14Q86W24 1093 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 CADM4Q8NFZ8 388 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 FRS2Q8WU20 508 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 OR8D1Q8WZ84 308 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC114Q96M63 670 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM129BQ96TA1 746 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 OMDQ99983 421 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIM7Q9C029 511 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 MAGEH1Q9H213 219 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 FBXL12Q9NXK8 326 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 DONSONQ9NYP3 566 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF212Q9UDV6 495 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 AP4E1Q9UPM8 1137 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 HS3ST2Q9Y278 367 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 PI4KAP42356 2102 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 DMDP11532 3685 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 AKR1B10O60218 316 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 IL1BP01584 269 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 C7P10643 843 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 SRCP12931 536 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 VAV1P15498 845 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 MIPP30301 263 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 GALCP54803 685 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 TPI1P60174 286 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 USP30Q70CQ3 517 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 RABEPKQ7Z6M1 372 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF354CQ86Y25 554 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 CNGA4Q8IV77 575 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 CEP76Q8TAP6 659 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 NUP85Q9BW27 656 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 SGK2Q9HBY8 427 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 ABHD10Q9NUJ1 306 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 PILRBQ9UKJ0 227 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 MID1O15344 667 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 DAPK3O43293 454 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 RAMP2O60895 175 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 MFAP3LO75121 409 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 ADH1BP00325 375 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 MT-CO1P00395 513 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 CYP1A2P05177 515 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 C5AR1P21730 350 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 GLDCP23378 1020 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 HTR7P34969 479 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 HOXD12P35452 270 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 PSMD8P48556 350 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 CLCN6P51797 869 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC18A3Q16572 532 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 DUOXA1Q1HG43 343 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM46CQ5VWP2 391 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 LINGO4Q6UY18 593 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 Q6ZVU0 165 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 NETO1Q8TDF5 533 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC42Q96M95 316 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 RBSNQ9H1K0 784 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM74BQ9NUR3 256 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 NDFIP2Q9NV92 336 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 IP6K2Q9UHH9 426 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 ANAPC7Q9UJX3 599 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-209ENST00000484097 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms