RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MOSPD2Q8NHP6 518 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 GRIP2Q9C0E4 1043 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TMX2Q9Y320 296 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 FGFR1P11362 822 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MYL4P12829 197 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MIPP30301 263 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 OR1E1P30953 314 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 NEPROQ6NW34 567 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXW8Q8N3Y1 598 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 POMGNT2Q8NAT1 580 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 OSMRQ99650 979 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TBCDQ9BTW9 1192 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO44Q9H4M3 255 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MROH8Q9H579 483 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF4O00268 1085 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 BTN3A1O00481 513 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SASH3O75995 380 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 IFNGR2P38484 337 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TUBP50607 506 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 BACE1P56817 501 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 NAB1Q13506 487 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSWIM7Q19AV6 140 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SPDYCQ5MJ68 293 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PROX1Q92786 737 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MED8Q96G25 268 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PANX3Q96QZ0 392 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SLITRK2Q9H156 845 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CHST7Q9NS84 486 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 INVSQ9Y283 1065 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 POLR1DQ9Y2S0 133 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 COL24A1Q17RW2 1714 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 USP12O75317 370 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 LBPP18428 481 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL14P50914 215 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TBX4P57082 545 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 NRF1Q16656 503 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 HASPINQ8TF76 798 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CKAP2Q8WWK9 683 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf50Q9BV19 199 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 GDF3Q9NR23 364 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.16□□□□□ -0.629e-8■■□□□ 11.8
EFTUD2-202ENST00000426333 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ZPBP2Q6X784 338 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CROCCP3Q8IVE0 287 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFB106AQ8N104 65 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF671Q8TAW3 534 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 STARD8Q92502 1023 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CPB2Q96IY4 423 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 EHD4Q9H223 541 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ATRNO75882 1429 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 HACD1B0YJ81 288 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 RGS14O43566 566 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CAPN1P07384 714 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TGFB3P10600 412 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 RBL1P28749 1068 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 WEE1P30291 646 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MEA1Q16626 185 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM187BQ17R55 369 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 C16orf46Q6P387 395 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 BBS4Q96RK4 519 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SPON1Q9HCB6 807 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 OPTCQ9UBM4 332 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SIK3Q9Y2K2 1263 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFB5O43674 189 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 UNC5CO95185 931 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TFRCP02786 760 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPN3P26045 913 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ITGADQ13349 1161 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 GSTA3Q16772 222 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SCUBE3Q8IX30 993 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRN4CLQ8ND94 238 aa11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms