RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OXCT1P55809 520 aa17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAS2R38P59533 333 aa17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUCB2P80303 420 aa17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP3CAQ08209 521 aa17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NNTQ13423 1086 aa17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STK38Q15208 465 aa17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF284Q2VY69 593 aa17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACCSLQ4AC99 568 aa17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C4orf17Q53FE4 359 aa17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF542PQ5EBM4 170 aa17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q6ZSR6 202 aa17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYEOVQ96EZ4 313 aa17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SERPINB11Q96P15 392 aa17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP1R9BQ96SB3 815 aa17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM8AQ9HCN3 771 aa17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEPT10Q9P0V9 454 aa17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TLR6Q9Y2C9 796 aa17.02■□□□□ 0.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AQP9O43315 295 aa17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CALUO43852 315 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NOBOXO60393 691 aa17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LTFP02788 710 aa17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIM49P0CI25 452 aa17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIM49CP0CI26 452 aa17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LIPCP11150 499 aa17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCP1P13796 627 aa17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NME1P15531 152 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CASP1P29466 404 aa17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NASPP49321 788 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPIDRQ14159 915 aa17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GCNT7Q6ZNI0 430 aa17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLK6Q92876 244 aa17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NOX5Q96PH1 765 aa17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL12RB2Q99665 862 aa17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FZD3Q9NPG1 666 aa17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC25A13Q9UJS0 675 aa17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP9BO43861 1147 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP6R2O75170 966 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GTF2H1P32780 548 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLK1P53350 603 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLDN2P57739 230 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STK4Q13043 487 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CUL4BQ13620 913 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBR1Q16650 682 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRT39Q6A163 491 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CRTC1Q6UUV9 634 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PARGQ86W56 976 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 JAMLQ86YT9 394 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LGI2Q8N0V4 545 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXO39Q8N4B4 442 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00301Q8NCQ3 95 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF34Q969K3 372 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MMRN2Q9H8L6 949 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR27Q9NS67 375 aa17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLEC18AA5D8T8 446 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MUSKO15146 869 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPTLC2O15270 562 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRR29P0C7W0 189 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDGFRAP16234 1089 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDX1P52945 283 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FZD2Q14332 565 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TGIF1Q15583 401 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEFB133Q30KQ1 61 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MANEAQ5SRI9 462 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PERM1Q5SV97 790 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLEC18BQ6UXF7 455 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB11FIP2Q7L804 512 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLEC18CQ8NCF0 446 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBA3Q8TBC4 463 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BTN2A2Q8WVV5 523 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC39A13Q96H72 371 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STRADBQ9C0K7 418 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADNPQ9H2P0 1102 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAAP1Q9H8G2 361 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DYRK4Q9NR20 520 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EXOC1Q9NV70 894 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa16.99■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NVLO15381 856 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CUTAO60888 179 aa16.98■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDH8O95206 1070 aa16.98■□□□□ 0.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms