RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 MYPNQ86TC9 1320 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 DPPA5A6NC42 116 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 B4GALT5O43286 388 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR47O94967 919 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MATKP42679 507 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 LCLAT1Q6UWP7 414 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SH3KBP1Q96B97 665 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SYBUQ9NX95 663 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 AP4B1Q9Y6B7 739 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 C2orf71A6NGG8 1288 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 RAMP2O60895 175 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MAPK1P28482 360 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 USP4Q13107 963 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 C12orf29Q8N999 325 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SERPINB11Q96P15 392 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MYH2Q9UKX2 1941 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM155BO75949 473 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SP100P23497 879 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC18A1P54219 525 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC74AQ0VAA2 488 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 NEDD8Q15843 81 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CMC1Q7Z7K0 106 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM69Q86WT6 500 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CROCCP3Q8IVE0 287 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 FNDC5Q8NAU1 212 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRN4Q8WUT4 740 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF145Q96MT1 663 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC154A6NI56 674 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 USP17L7P0C7H9 530 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ERCC2P18074 760 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 OVOS1Q6IE37 1185 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 RINLQ6ZS11 566 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM126BQ8IXS8 530 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 KCTD4Q8WVF5 259 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 C10orf82Q8WW14 230 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAJB3Q8WWF6 145 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 P2RY11Q96G91 374 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC4A5Q9BY07 1137 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PIF1Q9H611 641 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 COL20A1Q9P218 1284 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC12A8A0AV02 714 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CASTOR2A6NHX0 329 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CSPG5O95196 566 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 KLF10Q13118 480 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ARHGEF7Q14155 803 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM60Q495X7 471 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 METTL21CQ5VZV1 264 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 STK32CQ86UX6 486 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 LBPP18428 481 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 RAB10P61026 200 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM86AQ8N2M4 240 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 OR56A4Q8NGH8 313 aa16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CILPO75339 1184 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 FGFR3P22607 806 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 NEK3P51956 506 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 STRADAQ7RTN6 431 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC52Q8N7C0 313 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MARK4Q96L34 752 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ADGRE3Q9BY15 652 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ELOVL4Q9GZR5 314 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 XPR1Q9UBH6 696 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 IRF1P10914 325 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 GRIA3P42263 894 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CLCN5P51795 746 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 EMC10Q5UCC4 262 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CLPTM1LQ96KA5 538 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SDCBP2Q9H190 292 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PALMDQ9NP74 551 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TAS2R1Q9NYW7 299 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 YDJCA8MPS7 323 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PEX1O43933 1283 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 LYNP07948 512 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ITGALP20701 1170 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 VAC14Q08AM6 782 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF220Q5VTB9 566 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SCUBE2Q9NQ36 999 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms