RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 PAK5Q9P286 719 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 RAB21Q9UL25 225 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 A0A0A0MRY4 1105 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 C5orf60A6NFR6 353 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 GCATO75600 419 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 WASHC5Q12768 1159 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 CALCOCO2Q13137 446 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 E2F7Q96AV8 911 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 SPATA13Q96N96 652 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 ATP13A1Q9HD20 1204 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 J3KR12 359 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 MATN3O15232 486 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 PTPN3P26045 913 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 ETFBP38117 255 aa22.35■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 USP33Q8TEY7 942 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 KXD1Q9BQD3 176 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 NFU1Q9UMS0 254 aa22.35■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 IVDP26440 423 aa22.34■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 OXCT1P55809 520 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 ZBTB17Q13105 803 aa22.34■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 IZUMO3Q5VZ72 239 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 PARM1Q6UWI2 310 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 VITQ6UXI7 678 aa22.34■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 ZNF567Q8N184 647 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 ASIC4Q96FT7 647 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 WHRNQ9P202 907 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 VPS28Q9UK41 221 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 CLEC4EQ9ULY5 219 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 OPHN1O60890 802 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 NEBLO76041 1014 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 PID1Q7Z2X4 250 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 NSMCE1Q8WV22 266 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 AGAP3Q96P47 875 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.34■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 CYP17A1P05093 508 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 MYBL2P10244 700 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 ITIH2P19823 946 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 ITGA8P53708 1063 aa22.33■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 C4orf22Q6V702 233 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 BBOF1Q8ND07 529 aa22.33■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 EBF3Q9H4W6 596 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 RAB6BQ9NRW1 208 aa22.33■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 F5H423 210 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 NFATC1O95644 943 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ARSAP15289 507 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 GLDCP23378 1020 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 LMAN2Q12907 356 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 TEX44Q53QW1 395 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 FAXCQ5TGI0 409 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.32■■□□□ 1.16
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