RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 TAC1P20366 129 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 TACR2P21452 398 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 SLC18A2Q05940 514 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 NIPAL4Q0D2K0 466 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 SNX30Q5VWJ9 437 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 TPGS2Q68CL5 300 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 LVRNQ6Q4G3 990 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 OTOP2Q7RTS6 562 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 PIGWQ7Z7B1 504 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 TTC17Q96AE7 1141 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 NACA2Q9H009 215 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 SLC17A7Q9P2U7 560 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ZNF212Q9UDV6 495 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 HMX2A2RU54 273 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD65E5RJM6 399 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 PSMD3O43242 534 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ATP9BO43861 1147 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 KRT37O76014 449 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ZWINTO95229 277 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 PEX11BO96011 259 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 POLBP06746 335 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ALDH1A3P47895 512 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 NPY2RP49146 381 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 PLD1Q13393 1074 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 HECTD3Q5T447 861 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 LGSNQ5TDP6 509 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 HHATQ5VTY9 493 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 LRRC49Q8IUZ0 686 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 LGI2Q8N0V4 545 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 TMEM199Q8N511 208 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ZNF276Q8N554 614 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 PDZD8Q8NEN9 1154 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 OVCA2Q8WZ82 227 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 FAM169AQ9Y6X4 670 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 COCHO43405 550 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 URODP06132 367 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ERVK-10P10266 1014 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 SLC6A4P31645 630 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 RAB33AQ14088 237 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 SPANXN3Q5MJ09 141 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 MROH9Q5TGP6 573 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 RFWD3Q6PCD5 774 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 CFAP52Q8N1V2 620 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 YME1L1Q96TA2 773 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 HSFX1Q9UBD0 423 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 LPXNO60711 386 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 RFPL1O75677 317 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ANXA9O76027 345 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ADRA1DP25100 572 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 NEK3P51956 506 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 TAF12Q16514 161 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 C6orf89Q6UWU4 347 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 NECAB2Q7Z6G3 386 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 RASSF3Q86WH2 238 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ZNF354CQ86Y25 554 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 IPMKQ8NFU5 416 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 APOPT1Q96IL0 206 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 KLHL5Q96PQ7 755 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 TBL1YQ9BQ87 522 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 CHRAC1Q9NRG0 131 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 GKN1Q9NS71 199 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 PSAT1Q9Y617 370 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 MYLKQ15746 1914 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 PRRG1O14668 218 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ACSL4O60488 711 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 KRT38O76015 456 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 NEBLO76041 1014 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 NUMBP49757 651 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 MGAT5Q09328 741 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 TWF1Q12792 350 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 CDH17Q12864 832 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 IFT88Q13099 833 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ANO4Q32M45 955 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 LINC00523Q86TU6 105 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 SPOCK2Q92563 424 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 PSMG2Q969U7 264 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 MYRFLQ96LU7 910 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 FICDQ9BVA6 458 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 RNF38Q9H0F5 515 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 C2orf78A6NCI8 922 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 F5H5T6 163 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 EFCAB14O75071 495 aa18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms