RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 TUBB6Q9BUF5 446 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SHROOM3Q8TF72 1996 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 ANXA9O76027 345 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 HAUS5O94927 633 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 GSRP00390 522 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SLC2A3P11169 496 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 GRK4P32298 578 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 MAGEA11P43364 429 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 LHX8Q68G74 356 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 MSANTD2Q6P1R3 559 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 DCLK2Q8N568 766 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 ISL2Q96A47 359 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 AGAP2Q99490 1192 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 GLOD4Q9HC38 313 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 CD248Q9HCU0 757 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 NDFIP2Q9NV92 336 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 THAP1Q9NVV9 213 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SERPINB8P50452 374 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 CEP57Q86XR8 500 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 LRRC49Q8IUZ0 686 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 ABI1Q8IZP0 508 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SPATA22Q8NHS9 363 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 TBL1YQ9BQ87 522 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SNX15Q9NRS6 342 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 ARVCFO00192 962 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 MAGEA12P43365 314 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 CDK18Q07002 472 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 PPM1JQ5JR12 505 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 AFMIDQ63HM1 303 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 C14orf80Q86SX3 495 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SLC39A13Q96H72 371 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 KIFC1Q9BW19 673 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 MPP6Q9NZW5 540 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 FNIP2Q9P278 1114 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa22.15■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 CEP350Q5VT06 3117 aa22.14■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 WASH4PA8MWX3 477 aa22.14■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 SELPP16109 830 aa22.14■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 SLC8A1P32418 973 aa22.14■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.14■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.133e-6■■□□□ 13.4
SPHK1-201ENST00000323374 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 GMIPQ9P107 970 aa22.14■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 INHAP05111 366 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 NMBRP28336 390 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 GEMP55040 296 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 TBX4P57082 545 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 USP46P62068 366 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 MPP3Q13368 585 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PIK3R6Q5UE93 754 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 MBLAC2Q68D91 279 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF280DQ6N043 979 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 CAPNS2Q96L46 248 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.137e-7■■□□□ 11.9
SPHK1-201ENST00000323374 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 OR6C75A6NL08 312 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 TIMM44O43615 452 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 TRPA1O75762 1119 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PROCP04070 461 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PTPN4P29074 926 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PCID2Q5JVF3 399 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ICE2Q659A1 982 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PDPK2PQ6A1A2 396 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 CMC1Q7Z7K0 106 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 IPMKQ8NFU5 416 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 C20orf27Q9GZN8 174 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 NEBLO76041 1014 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 MPOP05164 745 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ANO4Q32M45 955 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC153Q494R4 210 aa22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130 ms