RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296127.7

ZDHHC3-201, Transcript of zinc finger DHHC-type containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZDHHC3, Length 3,101 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3-201ENST00000296127 LRCH4O75427 683 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 GABBR2O75899 941 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 CXCR2P25025 360 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 PSMA2P25787 234 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 GABPAQ06546 454 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 MERTKQ12866 999 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ZNF394Q53GI3 561 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 PIGZQ86VD9 579 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 KCTD6Q8NC69 237 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SGCDQ92629 289 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.025e-6■□□□□ 10.5
ZDHHC3-201ENST00000296127 ASB9Q96DX5 294 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 EFCAB1Q9HAE3 211 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SEPT3Q9UH03 358 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.94□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ITGB4P16144 1822 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 KCNN4O15554 427 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 HLA-DRAP01903 254 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 LIG4P49917 911 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 PRKAA2P54646 552 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 EVA1CP58658 441 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 PSME3P61289 254 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 GTF2BQ00403 316 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 AQP6Q13520 282 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 OR13F1Q8NGS4 319 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SH3GL1Q99961 368 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 AMNQ9BXJ7 453 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 PCDHGC3Q9UN70 934 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 PRORSD1PA6NEY8 169 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 CHADO15335 359 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TRPC1P48995 793 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 NME5P56597 212 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 DGKDQ16760 1214 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 WDR45BQ5MNZ6 344 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SLC39A4Q6P5W5 647 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 LAYNQ6UX15 382 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 FRA10AC1Q70Z53 315 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SLC22A16Q86VW1 577 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 FBXO11Q86XK2 927 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.93□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 AXIN1O15169 862 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 LTFP02788 710 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SPDYE6P0CI01 402 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TTKP33981 857 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SOX10P56693 466 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 IQSEC1Q6DN90 963 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 PSME2Q9UL46 239 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 CFBP00751 764 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 APOC2P02655 101 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ZNF846Q147U1 533 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 HTRA1Q92743 480 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 KCND2Q9NZV8 630 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SLC7A1P30825 629 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ABCG1P45844 678 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SLC13A2Q13183 592 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 WDR44Q5JSH3 913 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SLFN13Q68D06 897 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TIFABQ6ZNK6 161 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms