RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 CAMK2BQ13554 666 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 AGBL4Q5VU57 503 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 MFSD2AQ8NA29 543 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 TKTL2Q9H0I9 626 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 WDCPQ9H6R7 721 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 RRN3Q9NYV6 651 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 DKK4Q9UBT3 224 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 RAXQ9Y2V3 346 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 CNTN5O94779 1100 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 CXCR3P49682 368 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 SULT1E1P49888 294 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 BPIFB4P59827 614 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 CYP4F3Q08477 520 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 ALFQ53S48 1182 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 BRMS1LQ5PSV4 323 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 EID2Q8N6I1 236 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 NDST4Q9H3R1 872 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 STAP1Q9ULZ2 295 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 DMTF1Q9Y222 760 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 I6L893 689 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 RHOCP08134 193 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 SRCP12931 536 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 NUDT1P36639 197 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 KRT83P78385 493 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 BNIP3Q12983 259 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 DNAJC3Q13217 504 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 VWA3BQ502W6 1294 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM69Q86WT6 500 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 OXR1Q8N573 874 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM35BQ8NCS4 154 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 NT5C3BQ969T7 300 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 PSMB7Q99436 277 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 SNX10Q9Y5X0 201 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 FAM170AA1A519 330 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 SNAP91O60641 907 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 MT-CO1P00395 513 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 F9P00740 461 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 RXRGP48443 463 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 DEUP1Q05D60 604 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 STAT4Q14765 748 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 COL28A1Q2UY09 1125 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 MIIPQ5JXC2 388 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 IQCHQ86VS3 1027 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 TMPRSS12Q86WS5 348 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF683Q8IZ20 524 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 C18orf8Q96DM3 657 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 TBCBQ99426 244 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 VPS51Q9UID3 782 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 DSPP15924 2871 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 K7ERQ8 282 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 MAGEC1O60732 1142 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 RFPL3O75679 317 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 CTSLP07711 333 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 CYP11B1P15538 503 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 GABRB2P47870 512 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 TAS2R38P59533 333 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 KCNMA1Q12791 1236 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 OVGP1Q12889 678 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC31Q6UY01 552 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 ERICH1Q86X53 443 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC114Q96M63 670 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 PREBQ9HCU5 417 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 MPP6Q9NZW5 540 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 FHOD1Q9Y613 1164 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms