RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290810.7

NAE1-201, Transcript of NEDD8 activating enzyme E1 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NAE1, Length 1,837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1-201ENST00000290810 C1RP00736 705 aa20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 C8AP07357 584 aa20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 SPATA31D3P0C874 917 aa20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 ERVFC1P60507 584 aa20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 GNGT1P63211 74 aa20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 GUCY1A3Q02108 690 aa20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 TMED2Q15363 201 aa20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 ADGRF1Q5T601 910 aa20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 DENND1CQ8IV53 801 aa20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 CFAP36Q96G28 342 aa20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 LRRC3Q9BY71 257 aa20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 GLOD4Q9HC38 313 aa20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.47■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 LINC01553A4QN01 128 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 GLUD1P00367 558 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 SYN1P17600 705 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 CDH4P55283 916 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 LINC00523Q86TU6 105 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 TRABD2AQ86V40 505 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 TMC8Q8IU68 726 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 CENPTQ96BT3 561 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 GKN1Q9NS71 199 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.879e-9■■□□□ 12.7
NAE1-201ENST00000290810 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 ALDH1A2O94788 518 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 PGAM1P18669 254 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 MSH2P43246 934 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 IL10RBQ08334 325 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 SERINC3Q13530 473 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.874e-11■■■■□ 22.5
NAE1-201ENST00000290810 TEX26Q8N6G2 289 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 USP33Q8TEY7 942 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 DCAKDQ8WVC6 231 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 SP110Q9HB58 689 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 TLR9Q9NR96 1032 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 MOCS1Q9NZB8 636 aa20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
NAE1-201ENST00000290810 CLDN11O75508 207 aa20.45■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 HLA-DQB2P05538 268 aa20.45■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 PFKLP17858 780 aa20.45■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 MGAT1P26572 445 aa20.45■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.45■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 GAREM2Q75VX8 874 aa20.45■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 CHST9Q7L1S5 443 aa20.45■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.45■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 LRRC6Q86X45 466 aa20.45■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 OR52K1Q8NGK4 314 aa20.45■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 POF1BQ8WVV4 589 aa20.45■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 MAGEH1Q9H213 219 aa20.45■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 BFARQ9NZS9 450 aa20.45■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 HIDE1A8MVS5 230 aa20.44■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 H3BNC9 293 aa20.44■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 GABRR2P28476 465 aa20.44■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 LSP1P33241 339 aa20.44■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 SPARCL1Q14515 664 aa20.44■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 MARC1Q5VT66 337 aa20.44■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 ELMOD1Q8N336 334 aa20.44■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 TTC17Q96AE7 1141 aa20.44■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 SELENOSQ9BQE4 189 aa20.44■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.44■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 A0A1B0GVM2 712 aa20.43■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.43■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 FAM159BA6NKW6 160 aa20.43■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 J3KR12 359 aa20.43■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 RB1P06400 928 aa20.43■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 BRAFP15056 766 aa20.43■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 DNAJB1P25685 340 aa20.43■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 CDC25CP30307 473 aa20.43■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 NPY2RP49146 381 aa20.43■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 CLCN4P51793 760 aa20.43■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 GEMP55040 296 aa20.43■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 CDH17Q12864 832 aa20.43■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.43■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.43■□□□□ 0.86
NAE1-201ENST00000290810 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms