RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 INHAP05111 366 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 SFNP31947 248 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 TNFSF9P41273 254 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 GLRBP48167 497 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 HSPA13P48723 471 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 NDST2P52849 883 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 WNT7BP56706 349 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 DMPKQ09013 629 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 TFDP2Q14188 446 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 ANO4Q32M45 955 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 ZACNQ401N2 412 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 PERM1Q5SV97 790 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 CCDC80Q76M96 950 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 ARCQ7LC44 396 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 LILRA2Q8N149 483 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 TSNARE1Q96NA8 513 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 STRA6Q9BX79 667 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 SPATA7Q9P0W8 599 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 USP18Q9UMW8 372 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 CDY2AQ9Y6F7 541 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 CDY1Q9Y6F8 540 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 RREB1Q92766 1687 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 K7EPI3 171 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 MT-CO1P00395 513 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 GRK4P32298 578 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 CDK9P50750 372 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 LAMC2Q13753 1193 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 LRRC38Q5VT99 294 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 SLC39A4Q6P5W5 647 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 SNX31Q8N9S9 440 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 DPF3Q92784 378 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 MFSD14AQ96MC6 490 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 BRD8Q9H0E9 1235 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 CDHR5Q9HBB8 845 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 LAMB1P07942 1786 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM221A6NGB7 291 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 CLIC3O95833 236 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 SERPINB9P50453 376 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 GNA12Q03113 381 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 RALGDSQ12967 914 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 NR1D2Q14995 579 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 REPS2Q8NFH8 660 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 PPP1R14BQ96C90 147 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 VPS50Q96JG6 964 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 KLHL25Q9H0H3 589 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 FAM96AQ9H5X1 160 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF696Q9H7X3 374 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 PPME1Q9Y570 386 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 AP4S1Q9Y587 144 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 ATAD5Q96QE3 1844 aa11.02□□□□□ -0.64
CNGA3-201ENST00000272602 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 MATN2O00339 956 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 BIRC5O15392 142 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 PLIN3O60664 434 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 FKTNO75072 461 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 SNNO75324 88 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 UGT1A6P19224 532 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 UGT1A1P22309 533 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 UGT1A4P22310 534 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 NR4A1P22736 598 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 UGT1A3P35503 534 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 UGT1A5P35504 534 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 MYL6P60660 151 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 NME3Q13232 169 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 EEF1DP3Q658K8 133 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 SCARA3Q6AZY7 606 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 ZFP1Q6P2D0 407 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 UBR7Q8N806 425 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 ZBED2Q9BTP6 218 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 NDEL1Q9GZM8 345 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 RSAD1Q9HA92 442 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 IL1RL2Q9HB29 575 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 CISHQ9NSE2 258 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 GID8Q9NWU2 228 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 TLL2Q9Y6L7 1015 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 PTPRJQ12913 1337 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 HTR3EA5X5Y0 456 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 DHX15O43143 795 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 SLC10A3P09131 477 aa11.02□□□□□ -0.65
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF24P17028 368 aa11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms