RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.44□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 RFX8Q6ZV50 586 aa6.44□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 VPS33AQ96AX1 596 aa6.44□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.44□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 ZNF536O15090 1300 aa6.44□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 LIPMQ5VYY2 423 aa6.44□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 TMEM139Q8IV31 216 aa6.44□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.44□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.44□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 INCA1Q0VD86 236 aa6.44□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.44□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 AGR3Q8TD06 166 aa6.44□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 C1orf74Q96LT6 269 aa6.44□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.44□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 THTPAQ9BU02 230 aa6.44□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 CNTN3Q9P232 1028 aa6.44□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.43□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 CRHR1P34998 444 aa6.43□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 SESN3P58005 492 aa6.43□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 DEFB132Q7Z7B7 95 aa6.43□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.43□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 ARL8AQ96BM9 186 aa6.43□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.43□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.43□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.43□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 NOMO1Q15155 1222 aa6.43□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.43□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 SH3GL2Q99962 352 aa6.43□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 SLC2A11Q9BYW1 496 aa6.43□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 RHOJQ9H4E5 214 aa6.43□□□□□ -1.38
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