RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rbm20Q3UQS8 1199 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf148Q61624 794 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rxfp1Q6R6I7 758 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stk40Q7TNL3 435 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mapkap1Q8BKH7 522 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmtc3Q8BRH0 920 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cndp1Q8BUG2 492 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cabcoco1Q8CDT7 208 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nkiras1Q8CEC5 192 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbc1d22aQ8R5A6 516 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HnmtQ91VF2 295 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdhga10Q91XY9 930 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vangl2Q91ZD4 521 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmco1Q921L3 188 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dhrs7bQ99J47 323 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp4f16Q99N17 524 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zmat2Q9CPW7 199 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arl2Q9D0J4 184 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gfra4Q9JJT2 260 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fiz1Q9WTJ4 500 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nrf1Q9WU00 503 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Apobec2Q9WV35 224 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 B3galt4Q9Z0F0 371 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Phf11A6H5X4 337 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcsk6F6XJP7 959 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3383J3QQ59 259 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3164L7N2B9 238 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3239L7N2D9 227 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abcb1bP06795 1276 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RapsnP12672 412 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2b10P12791 500 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Il12aP43431 215 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sipa1P46062 1037 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc22a16Q497L8 649 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim67Q505D9 768 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr65Q61038 337 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem151aQ6GQT5 468 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Otud6aQ6IE21 290 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rasa4Q6PFQ7 802 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zdhhc17Q80TN5 632 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wscd1Q80XH4 572 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spata21Q8BHW6 681 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rmdn2Q8BSE0 410 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rap2cQ8BU31 183 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clptm1lQ8BXA5 539 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snrnp27Q8K194 155 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sec16bQ91XT4 1051 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrpl57Q9CQF8 102 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acbd6Q9D061 282 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Neurl2Q9D0S4 285 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 VapbQ9QY76 243 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 VarsQ9Z1Q9 1263 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nup205A0A0J9YUD5 2061 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf19bA2A7Q9 732 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Skint1A7TZE6 364 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r96E9PZU5 664 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm8909G3UXE9 396 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ZfrO88532 1074 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lmo2P25801 158 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HpcaP84075 193 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm1587Q3UT80 123 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aldh16a1Q571I9 802 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc5a10Q5SWY8 596 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abcd2Q61285 741 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc20a1Q61609 681 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Itih1Q61702 907 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Itga3Q62470 1053 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nqo1Q64669 274 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nlrp9cQ66X01 1004 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fastkd1Q6DI86 829 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dcaf15Q6PFH3 600 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cspg5Q71M36 566 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Celf6Q7TN33 460 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hsfy2Q80Y37 392 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Disc1Q811T9 852 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbxw21Q8BI38 468 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ankrd52Q8BTI7 1076 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Anapc2Q8BZQ7 837 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wdr59Q8C0M0 992 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Brat1Q8C3R1 822 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atg14Q8CDJ3 492 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gsg1Q8R1W2 324 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp6r2Q8R3Q2 923 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Alas1Q8VC19 642 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr356Q8VFP5 315 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adgrf4Q9D2L6 698 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dcaf6Q9DC22 876 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Akr1e2Q9DCT1 301 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp4f14Q9EP75 524 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim54Q9ERP3 366 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mmp19Q9JHI0 527 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trpm5Q9JJH7 1158 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spag6Q9JLI7 507 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Grm3Q9QYS2 879 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Map3k14Q9WUL6 942 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbk1Q9WUN2 729 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Disp2Q8CIP5 1345 aa6.72□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smim10l2aA0A0B4J1F8 78 aa6.71□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa6.71□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.1 ms