RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620505.1

TARDBP-222, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 657 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-222	ENST00000620505	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	C14orf80	Q86SX3	495 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	TMEM110	Q86TL2	294 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	KDM1B	Q8NB78	822 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	KLK6	Q92876	244 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	SKA1	Q96BD8	255 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	MED15	Q96RN5	788 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	CPXM1	Q96SM3	734 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	MYOC	Q99972	504 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	SIK2	Q9H0K1	926 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	THAP9	Q9H5L6	903 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	GDF3	Q9NR23	364 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	FZD4	Q9ULV1	537 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	CHD6	Q8TD26	2715 aa		9.02	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	TLR4	O00206	839 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	DFNA5	O60443	496 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	GNA14	O95837	355 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	CCR1	P32246	355 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	DRD3	P35462	400 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	CCR5	P51681	352 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	NXPH1	P58417	271 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	CNTN1	Q12860	1018 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	BECN1	Q14457	450 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	ARID5B	Q14865	1188 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	ACAP1	Q15027	740 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	FBXL22	Q6P050	247 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505		Q6ZVU0	165 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	SAP25	Q8TEE9	199 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	STK32A	Q8WU08	396 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	FRS2	Q8WU20	508 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	VPS28	Q9UK41	221 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	SPEG	Q15772	3267 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505		A0A1B0GVM2	712 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505		M0QYT0	321 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	SNAP91	O60641	907 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	PAGE1	O75459	146 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	RFPL3	O75679	317 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	CNTN5	O94779	1100 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	ERBB2	P04626	1255 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	PRLR	P16471	622 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	ACADVL	P49748	655 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	SEMG2	Q02383	582 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	SULT2A1	Q06520	285 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	9	□□□□□ -0.97	1e-13	■■■■■ 26.9
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	SLC12A1	Q13621	1099 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	STAT4	Q14765	748 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	DLG2	Q15700	870 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	CAMK4	Q16566	473 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	HES3	Q5TGS1	186 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	BEND5	Q7L4P6	421 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	ALG14	Q96F25	216 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	SPAG5	Q96R06	1193 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	MUC3B	Q9H195	1237 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	SYNC	Q9H7C4	482 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	FZD3	Q9NPG1	666 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		9	□□□□□ -0.97
TARDBP-222	ENST00000620505	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		9	□□□□□ -0.97

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