RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-205ENST00000588780 RAB20Q9NX57 234 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-205ENST00000588780 NLGN3Q9NZ94 848 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-205ENST00000588780 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-205ENST00000588780 PTPN13Q12923 2485 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-205ENST00000588780 CPED1A4D0V7 1026 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-205ENST00000588780 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-205ENST00000588780 BNIP3LO60238 219 aa22.46■■□□□ 1.19
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CAPNS1-205ENST00000588780 LTFP02788 710 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-205ENST00000588780 SETSIPP0DME0 302 aa22.46■■□□□ 1.19
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CAPNS1-205ENST00000588780 MXI1P50539 228 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-205ENST00000588780 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-205ENST00000588780 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-205ENST00000588780 KCTD13Q8WZ19 329 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-205ENST00000588780 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa22.46■■□□□ 1.19
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CAPNS1-205ENST00000588780 SLC46A1Q96NT5 459 aa22.46■■□□□ 1.19
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CAPNS1-205ENST00000588780 GTF2H1P32780 548 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF542PQ5EBM4 170 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 CHSY1Q86X52 802 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 DUSP23Q9BVJ7 150 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 USP29Q9HBJ7 922 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 FZD3Q9NPG1 666 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 DNAJC28Q9NX36 388 aa22.45■■□□□ 1.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.45■■□□□ 1.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 ADAM9Q13443 819 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 CDKN3Q16667 212 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 AGBL4Q5VU57 503 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 RAP1GAP2Q684P5 730 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 ARL14Q8N4G2 192 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 OR13H1Q8NG92 308 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 IRGQQ8WZA9 623 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 PAGE5Q96GU1 130 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 SERPINB11Q96P15 392 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 DOCK9Q9BZ29 2069 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 CAAP1Q9H8G2 361 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 PREBQ9HCU5 417 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1W2PQU0 124 aa22.43■■□□□ 1.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 VDRP11473 427 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 TGM2P21980 687 aa22.43■■□□□ 1.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 ARRDC3Q96B67 414 aa22.43■■□□□ 1.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 SLC25A13Q9UJS0 675 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 TLR6Q9Y2C9 796 aa22.43■■□□□ 1.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 STX10O60499 249 aa22.42■■□□□ 1.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 COLEC12Q5KU26 742 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 IGF2-ASQ6U949 168 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 CRTC1Q6UUV9 634 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 ATG14Q6ZNE5 492 aa22.42■■□□□ 1.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 RNF34Q969K3 372 aa22.42■■□□□ 1.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 TACR2P21452 398 aa22.41■■□□□ 1.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 CUL2Q13617 745 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC12A1Q13621 1099 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 RESP18Q5W5W9 173 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 PMF1Q6P1K2 205 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 USP53Q70EK8 1073 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 EXD3Q8N9H8 876 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM131CQ96AQ9 280 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM149B1Q96BN6 582 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 GRAMD1AQ96CP6 724 aa22.41■■□□□ 1.18
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