RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	GJD2	Q9UKL4	321 aa		3.37	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	COX11	Q9Y6N1	276 aa		3.37	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRANK1	O15050	2925 aa		3.37	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		3.37	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	FANCA	O15360	1455 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	DPPA5	A6NC42	116 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CXorf65	A6NEN9	183 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SH3BP5	O60239	455 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	USP12	O75317	370 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	WEE2	P0C1S8	567 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CYP4B1	P13584	511 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	XBP1	P17861	261 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRPH2	P23942	346 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	EPHB2	P29323	1055 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	PNPLA4	P41247	253 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CPA2	P48052	419 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	GHRHR	Q02643	423 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TLE2	Q04725	743 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF91	Q05481	1191 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TDG	Q13569	410 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	STIM1	Q13586	685 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	GALNT3	Q14435	633 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	GXYLT1	Q4G148	440 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ATG16L1	Q676U5	607 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ANO7	Q6IWH7	933 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CPO	Q8IVL8	374 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM47B	Q8NA70	645 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	USP38	Q8NB14	1042 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	IP6K1	Q92551	441 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CUL5	Q93034	780 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	GGA3	Q9NZ52	723 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	KL	Q9UEF7	1012 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SUFU	Q9UMX1	484 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	VCAN	P13611	3396 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	JCAD	Q9P266	1359 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	PPP6C	O00743	305 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TUBB4A	P04350	444 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	IGFBP2	P18065	325 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TFEB	P19484	476 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	RPS6KB1	P23443	525 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRKCH	P24723	683 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CERS1	P27544	350 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CD38	P28907	300 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CIITA	P33076	1130 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	DDIT3	P35638	169 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	PGM1	P36871	562 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SOX2	P48431	317 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	OAZ1	P54368	228 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC12A2	P55011	1212 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	VAMP2	P63027	116 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	FOXF2	Q12947	444 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRPC3	Q13507	836 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	MTFR2	Q6P444	385 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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