RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 SMC2O95347 1197 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SERPINC1P01008 464 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TUBB4AP04350 444 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ALPPP05187 535 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 INHBAP08476 426 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 FTH1P19P0C7X4 201 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 POLR2MP0CAP2 368 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ALPPL2P10696 532 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 GNAT1P11488 350 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SRCP12931 536 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ERCC2P18074 760 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CDH3P22223 829 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CPT2P23786 658 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 NF2P35240 595 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 GPD2P43304 727 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CAMLGP49069 296 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CAPZA1P52907 286 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 BLVRAP53004 296 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 PNLIPRP1P54315 467 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ATP8B2P98198 1209 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 PPATQ06203 517 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 GALNT3Q14435 633 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 NEDD9Q14511 834 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM132BQ14DG7 1078 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 PDK1Q15118 436 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 DPYSL2Q16555 572 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 HADHQ16836 314 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 PROSER3Q2NL68 480 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CRY2Q49AN0 593 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CFAP221Q4G0U5 840 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB41Q5JT25 222 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 RRAGBQ5VZM2 374 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CST9LP1Q5W188 147 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 HMBOX1Q6NT76 420 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SARM1Q6SZW1 724 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 RRAGAQ7L523 313 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TAS2R42Q7RTR8 314 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ADCK2Q7Z695 626 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM217AQ8IXS0 508 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC65Q8IXS2 484 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SCYL3Q8IZE3 742 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 WDTC1Q8N5D0 677 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKRD44Q8N8A2 993 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 VGLL2Q8N8G2 317 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ATAD1Q8NBU5 361 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 OR14C36Q8NHC7 312 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SCAMP5Q8TAC9 235 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TSPEARQ8WU66 669 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC13A3Q8WWT9 602 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 RABGGTAQ92696 567 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 STAMQ92783 540 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 MR1Q95460 341 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB7BQ96AH8 199 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 EEF2KMTQ96G04 330 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ERO1AQ96HE7 468 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CLPTM1LQ96KA5 538 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 C16orf92Q96LL3 132 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CFAP57Q96MR6 1250 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 PKP4Q99569 1192 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TUBB6Q9BUF5 446 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC106Q9BWC9 280 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 MTMR12Q9C0I1 747 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CCSER1Q9C0I3 900 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC25A18Q9H1K4 315 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CARD9Q9H257 536 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 GREM2Q9H772 168 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNH7Q9NS40 1196 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TDP1Q9NUW8 608 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TBC1D23Q9NUY8 699 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 UCKL1Q9NWZ5 548 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 HSPBP1Q9NZL4 362 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TMOD2Q9NZR1 351 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 FTSJ1Q9UET6 329 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 FETUBQ9UGM5 382 aa3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms