RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547318.5

LETMD1-209, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LETMD1, Length 2,001 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-209ENST00000547318 GJA5P36382 358 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CSRP3P50461 194 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 TKTL1P51854 596 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CDH17Q12864 832 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ITGA9Q13797 1035 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 GPR142Q7Z601 462 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 DHDDSQ86SQ9 333 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 OSTM1Q86WC4 334 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 OR52K1Q8NGK4 314 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 FBXO27Q8NI29 283 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 GPR22Q99680 433 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 LPIN3Q9BQK8 851 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CDH22Q9UJ99 828 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 VPS28Q9UK41 221 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 GINS2Q9Y248 185 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 WASF2Q9Y6W5 498 aa14.92□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CACNG3O60359 315 aa14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 THRAP10827 490 aa14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 MLH1P40692 756 aa14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 NME3Q13232 169 aa14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 MFSD10Q14728 455 aa14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 BSPRYQ5W0U4 402 aa14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 MOB2Q70IA6 237 aa14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 MAVSQ7Z434 540 aa14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 KCNMB4Q86W47 210 aa14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 SYT15Q9BQS2 421 aa14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 OXSMQ9NWU1 459 aa14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 GJD2Q9UKL4 321 aa14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 IPPQ9Y573 584 aa14.91□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 G3V2L1 256 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 HAS3O00219 553 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 HCRTO43612 131 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 SERPINB5P36952 375 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 HERC3Q15034 1050 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 LIPMQ5VYY2 423 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 C16orf89Q6UX73 402 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ZYG11AQ6WRX3 759 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 IFT43Q96FT9 208 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 TEKT5Q96M29 485 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 TSC22D3Q99576 134 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 KIFC1Q9BW19 673 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 DRC3Q9H069 523 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 RHOJQ9H4E5 214 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 PNPOQ9NVS9 261 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 HACD3Q9P035 362 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 TLK1Q9UKI8 766 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CDH9Q9ULB4 789 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 Q9Y3F1 56 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 LTFP02788 710 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 COX4I1P13073 169 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 GLDCP23378 1020 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CDC25CP30307 473 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CXCR3P49682 368 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 CACNA2D1P54289 1103 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 PRKAA1Q13131 559 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 FAM110CQ1W6H9 321 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 SH2D4BQ5SQS7 431 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 SYPL2Q5VXT5 272 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ACAD11Q709F0 780 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 LZTR1Q8N653 840 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 ULBP1Q9BZM6 244 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 COG4Q9H9E3 785 aa14.9□□□□□ -0.02
LETMD1-209ENST00000547318 HDAC3O15379 428 aa14.89□□□□□ -0.03
LETMD1-209ENST00000547318 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LETMD1-209ENST00000547318 BUD23O43709 281 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
LETMD1-209ENST00000547318 C2P06681 752 aa14.89□□□□□ -0.03
LETMD1-209ENST00000547318 PCSK1P29120 753 aa14.89□□□□□ -0.03
LETMD1-209ENST00000547318 CPT1AP50416 773 aa14.89□□□□□ -0.03
LETMD1-209ENST00000547318 MTTPP55157 894 aa14.89□□□□□ -0.03
LETMD1-209ENST00000547318 TMEM62Q0P6H9 643 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms