RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 HBP1O60381 514 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 GJB3O75712 270 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 MT-CO3P00414 261 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 TUBB4AP04350 444 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 HOXA5P20719 270 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 NFKBIAP25963 317 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
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PGGT1B-205ENST00000514178 CYP4F2P78329 520 aa8.32□□□□□ -1.08
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PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.32□□□□□ -1.08
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PGGT1B-205ENST00000514178 TERB1Q8NA31 727 aa8.32□□□□□ -1.08
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PGGT1B-205ENST00000514178 SLC32A1Q9H598 525 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 PEMTQ9UBM1 199 aa8.32□□□□□ -1.08
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PGGT1B-205ENST00000514178 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
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PGGT1B-205ENST00000514178 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 C16orf96A6NNT2 1141 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 P4HA2O15460 535 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 EXOC3O60645 756 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 SEC14L2O76054 403 aa8.31□□□□□ -1.08
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PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.31□□□□□ -1.08
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PGGT1B-205ENST00000514178 SETD9Q8NE22 299 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 ACTRT2Q8TDY3 377 aa8.31□□□□□ -1.08
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PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 PCDHGB4Q9UN71 923 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNE2Q9Y6J6 123 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 VILLO15195 856 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 CEP104O60308 925 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 DRD4P21917 467 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 TGM2P21980 687 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 DGCR2P98153 550 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 MED22Q15528 200 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 DUSP28Q4G0W2 176 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 C17orf99Q6UX52 265 aa8.3□□□□□ -1.08
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PGGT1B-205ENST00000514178 HIC2Q96JB3 615 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.3□□□□□ -1.08
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PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 CHAF1BQ13112 559 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 TUBA3CQ13748 450 aa8.29□□□□□ -1.08
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PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF804AQ7Z570 1209 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 ULK2Q8IYT8 1036 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 WDTC1Q8N5D0 677 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 SYBUQ9NX95 663 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 LRIT1Q9P2V4 623 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-205ENST00000514178 DTX4Q9Y2E6 619 aa8.29□□□□□ -1.08
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