RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 CDYLQ9Y232 598 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ADGRB3O60242 1522 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 UBE2QL1A1L167 161 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 FRMD3A2A2Y4 597 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 SMTNL1A8MU46 457 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 NUAK1O60285 661 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TBX10O75333 385 aa2.39□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 OAZ1P54368 228 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 RPL15P61313 204 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 RPS7P62081 194 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 STAMQ92783 540 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 SMARCE1Q969G3 411 aa2.39□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 SH2D4AQ9H788 454 aa2.39□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 THBS4P35443 961 aa2.38□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 KIAA2012Q0VF49 1180 aa2.38□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 AADACL2Q6P093 401 aa2.38□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 FOXR2Q6PJQ5 311 aa2.38□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM108Q6UXF1 575 aa2.38□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa2.38□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ANKRD35Q8N283 1001 aa2.38□□□□□ -2.03
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