RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-210ENST00000505941 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-210ENST00000505941 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ILVBLA1L0T0 632 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 CCP110O43303 1012 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF8O76064 485 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 PSMA2P25787 234 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ETFBP38117 255 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 PTGER3P43115 390 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 NUMBP49757 651 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 RPS14P62263 151 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 TMC6Q7Z403 805 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM124AQ86V42 546 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 CADM4Q8NFZ8 388 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 CEP76Q8TAP6 659 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 NETO1Q8TDF5 533 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF653Q96CK0 615 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 MYO19Q96H55 970 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 SPON2Q9BUD6 331 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR174Q9BXC1 333 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF292O60281 2723 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 CKAP5Q14008 2032 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 MEI4A8MW99 385 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 GNSP15586 552 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 CASP14P31944 242 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 HOXD12P35452 270 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 STK19P49842 368 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 VASPP50552 380 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 C9orf64Q5T6V5 341 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP11CQ8NB49 1132 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 TBC1D31Q96DN5 1066 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ALG14Q96F25 216 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC114Q96M63 670 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 HSPA12BQ96MM6 686 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 NCAPGQ9BPX3 1015 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 MTG2Q9H4K7 406 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 MYO1AQ9UBC5 1043 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 CFAP54Q96N23 3096 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 IGLV3-19P01714 112 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 GYPCP04921 128 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 RHOQP17081 205 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ITPKAP23677 461 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 SCAPQ12770 1279 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 RAB6CQ53S08 254 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 RETSATQ6NUM9 610 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 DRC7Q8IY82 874 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC185Q8N715 623 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 EPAS1Q99814 870 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 OMDQ99983 421 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 BTBD1Q9H0C5 482 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 RAB6CQ9H0N0 254 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ISCUQ9H1K1 167 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 SMOC1Q9H4F8 434 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 DONSONQ9NYP3 566 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 SUSD2Q9UGT4 822 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 PILRBQ9UKJ0 227 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 OR51B4Q9Y5P0 310 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP9BO43861 1147 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ADH1BP00325 375 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 L1CAMP32004 1257 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 MAPKAPK2P49137 400 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC20A2Q08357 652 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 DLG2Q15700 870 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 DUOXA1Q1HG43 343 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 HGSNATQ68CP4 663 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 IL31Q6EBC2 164 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 USP30Q70CQ3 517 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 STK40Q8N2I9 435 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 DCAF4L2Q8NA75 395 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 OR8K1Q8NGG5 319 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 OR52K2Q8NGK3 314 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 OR8D1Q8WZ84 308 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPRN2Q92932 1015 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 RMDN1Q96DB5 314 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 RTKNQ9BST9 563 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 PCED1AQ9H1Q7 454 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 SGK2Q9HBY8 427 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP13A1Q9HD20 1204 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 CD93Q9NPY3 652 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 FBXL12Q9NXK8 326 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM191CA6NGB0 347 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 CBX4O00257 560 aa21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms