RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481356.1

SRPRB-203, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 1,487 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-203ENST00000481356 RTN2O75298 545 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 ZNF217O75362 1048 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 CLDN11O75508 207 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 PSMA2P25787 234 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 MAOBP27338 520 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 CD6P30203 668 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 METAP1P53582 386 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 MAMLD1Q13495 774 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 ACCSLQ4AC99 568 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 C9orf64Q5T6V5 341 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 LYSMD4Q5XG99 296 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 LINGO4Q6UY18 593 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 TMC6Q7Z403 805 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 PTPRN2Q92932 1015 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 C1orf74Q96LT6 269 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 PPP1R9BQ96SB3 815 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 ZYG11BQ9C0D3 744 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 ITM2CQ9NQX7 267 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 ZNF212Q9UDV6 495 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 OR12D3Q9UGF7 316 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 SERGEFQ9UGK8 458 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 SUN2Q9UH99 717 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 DNAI1Q9UI46 699 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 VPS51Q9UID3 782 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 SLC25A13Q9UJS0 675 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 NEU3Q9UQ49 428 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 CEP250Q9BV73 2442 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 ITIH6Q6UXX5 1313 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 PCDH15Q96QU1 1955 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 A0A087X0T9 212 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 MID1O15344 667 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 LRIG2O94898 1065 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 MT-CO1P00395 513 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 SERPING1P05155 500 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 ZNF806P0C7X5 589 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 FAM228BP0C875 321 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 OR1E1P30953 314 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 ACVRL1P37023 503 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 NNMTP40261 264 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 ID4P47928 161 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 PSMD8P48556 350 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 PLK1P53350 603 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 OXCT1P55809 520 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 ZNF33AQ06730 810 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 SLC12A1Q13621 1099 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 ARL13BQ3SXY8 428 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 POM121L1PQ3SYA9 428 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 MANEALQ5VSG8 457 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 SLC36A4Q6YBV0 504 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 LEKR1Q6ZMV7 388 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 Q6ZVU0 165 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 SLFN11Q7Z7L1 901 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 GANCQ8TET4 914 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 BTBD6Q96KE9 485 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 PEBP4Q96S96 227 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 SPON2Q9BUD6 331 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 PARVAQ9NVD7 372 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 PCSK1NQ9UHG2 260 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 FZD10Q9ULW2 581 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 A0A1W2PP55 124 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 RNF103O00237 685 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 CBFA2T2O43439 604 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 CREB3O43889 395 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 LRP3O75074 770 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 DNTTP04053 509 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 SRCP12931 536 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 ACSL1P33121 698 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 LMNB2Q03252 620 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 CA9Q16790 459 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 VPS36Q86VN1 386 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 VSTM4Q8IW00 320 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 RGL4Q8IZJ4 473 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 NETO2Q8NC67 525 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 FRS2Q8WU20 508 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 TBC1D31Q96DN5 1066 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 ARHGEF26Q96DR7 871 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 VCPIP1Q96JH7 1222 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 FAM129BQ96TA1 746 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 CNPY3Q9BT09 278 aa11.35□□□□□ -0.59
SRPRB-203ENST00000481356 THAP2Q9H0W7 228 aa11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms