RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468534.1

CCDC88A-210, Transcript of coiled-coil domain containing 88A, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC88A, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88A-210ENST00000468534 ADPRHL2Q9NX46 363 aa5.13□□□□□ -1.59
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CCDC88A-210ENST00000468534 CORO2BQ9UQ03 480 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC88A-210ENST00000468534 CNPY2Q9Y2B0 182 aa5.13□□□□□ -1.59
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CCDC88A-210ENST00000468534 DTNAQ9Y4J8 743 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC88A-210ENST00000468534 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
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CCDC88A-210ENST00000468534 HSPA7P48741 367 aa5.12□□□□□ -1.59
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CCDC88A-210ENST00000468534 C17orf67Q0P5P2 114 aa5.12□□□□□ -1.59
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CCDC88A-210ENST00000468534 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa5.11□□□□□ -1.59
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CCDC88A-210ENST00000468534 K7EPI3 171 aa5.11□□□□□ -1.59
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CCDC88A-210ENST00000468534 TRIM16O95361 564 aa5.11□□□□□ -1.59
CCDC88A-210ENST00000468534 SLU7O95391 586 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CCDC88A-210ENST00000468534 MLYCDO95822 493 aa5.11□□□□□ -1.59
CCDC88A-210ENST00000468534 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa5.11□□□□□ -1.59
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CCDC88A-210ENST00000468534 CTGFP29279 349 aa5.11□□□□□ -1.59
CCDC88A-210ENST00000468534 PTGER1P34995 402 aa5.11□□□□□ -1.59
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CCDC88A-210ENST00000468534 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CCDC88A-210ENST00000468534 ETV1P50549 477 aa5.11□□□□□ -1.59
CCDC88A-210ENST00000468534 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CCDC88A-210ENST00000468534 ITGA8P53708 1063 aa5.11□□□□□ -1.59
CCDC88A-210ENST00000468534 SLC12A3P55017 1021 aa5.11□□□□□ -1.59
CCDC88A-210ENST00000468534 ADKP55263 362 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CCDC88A-210ENST00000468534 COG7P83436 770 aa5.11□□□□□ -1.59
CCDC88A-210ENST00000468534 BEX3Q00994 111 aa5.11□□□□□ -1.59
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