RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PSMA2P25787 234 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RPS14P62263 151 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF33AQ06730 810 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAMLD1Q13495 774 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRIM14Q14142 442 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RAB6CQ53S08 254 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMC6Q7Z403 805 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RABEPKQ7Z6M1 372 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM124AQ86V42 546 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC185Q8N715 623 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPR174Q9BXC1 333 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MTG2Q9H4K7 406 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SCML1Q9UN30 329 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 THADAQ6YHU6 1953 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GYPCP04921 128 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ITPKAP23677 461 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HOXD12P35452 270 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AIF1P55008 147 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DSG4Q86SJ6 1040 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RMDN1Q96DB5 314 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ALG14Q96F25 216 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPON2Q9BUD6 331 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CEP250Q9BV73 2442 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CKAP5Q14008 2032 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ILVBLA1L0T0 632 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IGLV3-19P01714 112 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CASP14P31944 242 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ETFBP38117 255 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SCAPQ12770 1279 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TCEAL6Q6IPX3 200 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DRC7Q8IY82 874 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CADM4Q8NFZ8 388 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CEP76Q8TAP6 659 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TCEAL3Q969E4 200 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC114Q96M63 670 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EPAS1Q99814 870 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BTBD1Q9H0C5 482 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RNF8O76064 485 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CFIP05156 583 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GNSP15586 552 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RHOQP17081 205 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAPKAPK2P49137 400 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VASPP50552 380 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FOXK2Q01167 660 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CST6Q15828 149 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRIM61Q5EBN2 209 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HGSNATQ68CP4 663 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RETSATQ6NUM9 610 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STK40Q8N2I9 435 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OMDQ99983 421 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ISCUQ9H1K1 167 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SUSD2Q9UGT4 822 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VPS51Q9UID3 782 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PILRBQ9UKJ0 227 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 A0A0D9SEW6 157 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CBX4O00257 560 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATP9BO43861 1147 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRIG2O94898 1065 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ADH1BP00325 375 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IL1BP01584 269 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms