RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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PTPRK-211ENST00000429595 KIF18BQ86Y91 864 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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PTPRK-211ENST00000429595 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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PTPRK-211ENST00000429595 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 C2orf42Q9NWW7 574 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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PTPRK-211ENST00000429595 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 TENM4Q6N022 2769 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 PRSS38A1L453 326 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa6.79□□□□□ -1.32
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PTPRK-211ENST00000429595 FAM193AP78312 1265 aa6.79□□□□□ -1.32
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PTPRK-211ENST00000429595 B3GALT6Q96L58 329 aa6.79□□□□□ -1.32
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PTPRK-211ENST00000429595 LRRCC1Q9C099 1032 aa6.79□□□□□ -1.32
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PTPRK-211ENST00000429595 RHOP08100 348 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 ITPKBP27987 946 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 KIF5BP33176 963 aa6.78□□□□□ -1.32
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PTPRK-211ENST00000429595 CLCN3P51790 818 aa6.78□□□□□ -1.32
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PTPRK-211ENST00000429595 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.78□□□□□ -1.32
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PTPRK-211ENST00000429595 TTC8Q8TAM2 541 aa6.78□□□□□ -1.32
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PTPRK-211ENST00000429595 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 ASXL3Q9C0F0 2248 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 FRMPD4Q14CM0 1322 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 TTC41PQ6P2S7 1318 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 C22orf31O95567 290 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 APBB3O95704 486 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 POU2F2P09086 479 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PCP11498 1178 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 CEBPBP17676 345 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ELF1P32519 619 aa6.77□□□□□ -1.33
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